51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0643 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  72.77 
 
 
235 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  74.47 
 
 
235 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  82.84 
 
 
173 aa  290  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  74.58 
 
 
265 aa  287  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  82.04 
 
 
174 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  80.82 
 
 
236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4248  hypothetical protein  47.77 
 
 
192 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  48.41 
 
 
190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0691  hypothetical protein  45.05 
 
 
191 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0674  hypothetical protein  46.36 
 
 
204 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  0.849594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0763  hypothetical protein  50.36 
 
 
181 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652238  normal  0.0879583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4535  hypothetical protein  47.18 
 
 
188 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.026025  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  48.2 
 
 
188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  47.48 
 
 
188 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3486  hypothetical protein  40.62 
 
 
207 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0819  hypothetical protein  40.62 
 
 
207 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3615  hypothetical protein  40.62 
 
 
207 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  40 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2221  hypothetical protein  39.63 
 
 
212 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3082  hypothetical protein  32.42 
 
 
203 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0625328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2244  hypothetical protein  38.19 
 
 
216 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0932  hypothetical protein  34.57 
 
 
184 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2885  hypothetical protein  33.1 
 
 
172 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00516229  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2887  hypothetical protein  33.1 
 
 
172 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0294943  normal  0.352476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2866  putative periplasmic protein  33.57 
 
 
172 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00540777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2816  putative periplasmic protein  33.1 
 
 
172 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2999  hypothetical protein  33.1 
 
 
172 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2990  hypothetical protein  31.01 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2755  hypothetical protein  31.01 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.180367  normal  0.0107681 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3842  hypothetical protein  31.01 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00682027  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02456  hypothetical protein  31.01 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1071  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0222313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2887  hypothetical protein  31.01 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0165509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2762  hypothetical protein  31.01 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1080  hypothetical protein  31.01 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.072427  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02492  hypothetical protein  31.01 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  29.5 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  28.16 
 
 
199 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  27.07 
 
 
179 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  27.34 
 
 
179 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  26.28 
 
 
178 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  26.06 
 
 
183 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  25.93 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  24.26 
 
 
180 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  25.49 
 
 
167 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  29.86 
 
 
185 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  27.45 
 
 
177 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  22.09 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  28.97 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>