42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2244 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2244  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2221  hypothetical protein  63.69 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0691  hypothetical protein  45.2 
 
 		 191 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  45.71 
 
 		 188 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4535  hypothetical protein  45 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.026025  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3615  hypothetical protein  40.14 
 
 		 207 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0819  hypothetical protein  40.14 
 
 		 207 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3486  hypothetical protein  40.14 
 
 		 207 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  44.29 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0763  hypothetical protein  46.48 
 
 		 181 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652238  normal  0.0879583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0674  hypothetical protein  37.41 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  0.849594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  35.92 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4248  hypothetical protein  40.79 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  41.07 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  40.46 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  40.46 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  39.53 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  39.16 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  41.26 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  41.84 
 
 		 236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  38.19 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2755  hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.180367  normal  0.0107681 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1071  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0222313  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2990  hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  95.1  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3842  hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00682027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02456  hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1080  hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.072427  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2887  hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0165509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2762  hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02492  hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3082  hypothetical protein  35.17 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0625328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0932  hypothetical protein  34.04 
 
 		 184 aa  89  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  37.24 
 
 		 177 aa  88.6  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2866  putative periplasmic protein  31.69 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00540777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2887  hypothetical protein  31.69 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0294943  normal  0.352476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2816  putative periplasmic protein  31.69 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2999  hypothetical protein  31.69 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2885  hypothetical protein  31.69 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00516229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  26.32 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  32.88 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  24.34 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  24 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>