41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1080 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1071  conserved hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0222313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1080  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  7e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.072427  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02492  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  7e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2887  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  7e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0165509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2762  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2990  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  7e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3842  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00682027  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02456  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  7e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359023  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2755  hypothetical protein  97.67 
 
 
172 aa  330  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.180367  normal  0.0107681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2866  putative periplasmic protein  65.88 
 
 
172 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00540777 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2999  hypothetical protein  65.88 
 
 
172 aa  224  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2816  putative periplasmic protein  65.88 
 
 
172 aa  224  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2887  hypothetical protein  65.88 
 
 
172 aa  224  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0294943  normal  0.352476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2885  hypothetical protein  65.29 
 
 
172 aa  223  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00516229  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3082  hypothetical protein  61.68 
 
 
203 aa  214  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0625328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0932  hypothetical protein  39.11 
 
 
184 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3486  hypothetical protein  35.75 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3615  hypothetical protein  35.75 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0819  hypothetical protein  35.75 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2221  hypothetical protein  32.4 
 
 
212 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0674  hypothetical protein  36.18 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  0.849594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0691  hypothetical protein  33.73 
 
 
191 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2244  hypothetical protein  32.89 
 
 
216 aa  94  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  36.96 
 
 
236 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  29.17 
 
 
235 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  31.07 
 
 
220 aa  88.2  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  28.65 
 
 
235 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0763  hypothetical protein  30.41 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652238  normal  0.0879583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4535  hypothetical protein  29.79 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.026025  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  29.58 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  32.61 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  32.61 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  32.61 
 
 
265 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  32.61 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  30.41 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4248  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  27.15 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  22.15 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  24.43 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  23.29 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>