46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1790 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  98.25 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  97.81 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  97.37 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  67.89 
 
 		 228 aa  310  7.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  64.89 
 
 		 239 aa  309  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  63.84 
 
 		 239 aa  307  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  57.82 
 
 		 227 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  47.31 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  47.93 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  41.63 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  38.39 
 
 		 242 aa  147  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  45.24 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  40.26 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  38.99 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  37.74 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  41.26 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  38.24 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  36.08 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  42.75 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  35.03 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  36.76 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  33.33 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  33.16 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  34.81 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  33.33 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  29.81 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  29.81 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  24.68 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  31.85 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  27.88 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  24.44 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  26.09 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  22.6 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  26.49 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  27.13 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  21.43 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  33.33 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  25.74 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  25.74 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>