More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1251 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  98.69 
 
 		 306 aa  587  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  98.69 
 
 		 306 aa  587  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  98.69 
 
 		 306 aa  587  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  98.37 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  88.24 
 
 		 306 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  88.24 
 
 		 306 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  87.91 
 
 		 306 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  87.91 
 
 		 306 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  87.91 
 
 		 306 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  87.91 
 
 		 306 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  87.91 
 
 		 306 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  82.84 
 
 		 304 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  68.28 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  68.28 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  67.93 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  68.12 
 
 		 307 aa  360  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  59.64 
 
 		 296 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  54.83 
 
 		 316 aa  291  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  57.72 
 
 		 296 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  55.56 
 
 		 304 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  55.56 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  55.22 
 
 		 306 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  56.43 
 
 		 304 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  54.67 
 
 		 306 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.55 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.12 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  43.54 
 
 		 301 aa  199  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  50.36 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  41.99 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  41.33 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.85 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.85 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  37.31 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  40.83 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  43.31 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  37.78 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.69 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.28 
 
 		 309 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  40.94 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.73 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  40.94 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  40.94 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  40.94 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  40.94 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  40.94 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  40.94 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  40.94 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.3 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  37.55 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  40.38 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.76 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  37.64 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  38.58 
 
 		 494 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  37.68 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 308 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  37.35 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  40.42 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.25 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  36.19 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  36.19 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  37.74 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  36.19 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  37.74 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  38.44 
 
 		 519 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02859  integral membrane protein  41.4 
 
 		 159 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  32.81 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  32.86 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  28.42 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  32.21 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.04 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 348 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  30.57 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  30.57 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.65 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  30.57 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  29.01 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  30.34 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  28.74 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  29.5 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  33.21 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  29.55 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  30.29 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  28.08 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  27.59 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  30.35 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  26.69 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.35 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  28.27 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>