More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3195 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3883  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.01 
 
 
826 aa  1248    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0168383  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0642  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  69.69 
 
 
826 aa  1234    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3167  putative peptidase  49.51 
 
 
819 aa  790    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0614  dipeptidyl peptidase IV, putative  70.77 
 
 
826 aa  1243    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02195  Dipeptidyl peptidase IV  46.66 
 
 
831 aa  775    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  100 
 
 
828 aa  1713    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.14 
 
 
826 aa  1251    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000738695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  69.69 
 
 
827 aa  1240    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000293911  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2525  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  49.59 
 
 
850 aa  825    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0608  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.08 
 
 
826 aa  1245    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  70.36 
 
 
831 aa  1246    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3422  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.14 
 
 
826 aa  1249    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.286167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  69.77 
 
 
827 aa  1235    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  73.7 
 
 
829 aa  1301    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.26 
 
 
826 aa  1249    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0576  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  70.41 
 
 
828 aa  1230    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.115519  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3014  dipeptidyl peptidase IV, putative  70.36 
 
 
824 aa  1204    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003026  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3700  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  71.01 
 
 
826 aa  1250    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000363184  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  70.53 
 
 
823 aa  1234    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000257692  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3933  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.03 
 
 
789 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0013  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.2 
 
 
795 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439144  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0015  dipeptidyl-peptidase  40.3 
 
 
795 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03743  dipeptidyl peptidase  39.97 
 
 
786 aa  571  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2851  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.61 
 
 
811 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.342438  normal  0.410655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1969  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.53 
 
 
787 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0328  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.53 
 
 
800 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.33 
 
 
767 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.33 
 
 
771 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.87 
 
 
771 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.79 
 
 
766 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  31.94 
 
 
763 aa  191  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.9 
 
 
750 aa  190  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.51 
 
 
760 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  31.71 
 
 
763 aa  187  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  31.25 
 
 
763 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  31.1 
 
 
763 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  29.98 
 
 
741 aa  180  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.16 
 
 
768 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  29.73 
 
 
775 aa  180  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.82 
 
 
765 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.6 
 
 
748 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  28.26 
 
 
768 aa  172  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4258  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.55 
 
 
812 aa  171  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.575828  normal  0.163799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.55 
 
 
733 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  28.82 
 
 
729 aa  165  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  28.26 
 
 
735 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.82 
 
 
741 aa  164  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.64 
 
 
767 aa  160  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0996  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.01 
 
 
771 aa  157  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.88 
 
 
751 aa  156  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1409  dipeptidyl-peptidase IV  27.87 
 
 
754 aa  154  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  25.62 
 
 
752 aa  154  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.7 
 
 
723 aa  151  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1194  Dipeptidyl-peptidase IV  28.06 
 
 
757 aa  151  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.929099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1151  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.83 
 
 
750 aa  150  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16756  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0505  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.51 
 
 
709 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  29.01 
 
 
568 aa  141  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04800  dipeptidyl aminopeptidase IV  25.25 
 
 
721 aa  141  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  25.67 
 
 
732 aa  138  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.14 
 
 
724 aa  136  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.58 
 
 
721 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1057  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.26 
 
 
737 aa  135  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0728154  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4504  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.13 
 
 
739 aa  135  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0056  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  25 
 
 
747 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3418  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.57 
 
 
738 aa  130  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_002950  PG0503  dipeptidyl aminopeptidase IV  27.14 
 
 
723 aa  129  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0485  putative peptidase  35.07 
 
 
711 aa  127  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.38 
 
 
692 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2523  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.43 
 
 
740 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4028  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25 
 
 
732 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.17 
 
 
652 aa  121  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2538  Dipeptidyl-peptidase IV  26.26 
 
 
1006 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2619  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.05 
 
 
735 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1624  dipeptidyl-peptidase IV  34.2 
 
 
228 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1335  peptidase S9, dipeptidylpeptidase  27.77 
 
 
749 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1085  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.49 
 
 
718 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.968267  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23950  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.3 
 
 
711 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111668  normal  0.0730472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3909  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.85 
 
 
732 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2549  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.69 
 
 
725 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3655  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.09 
 
 
726 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0640869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  26.26 
 
 
678 aa  111  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3912  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.11 
 
 
701 aa  111  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.25 
 
 
617 aa  109  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5657  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.44 
 
 
693 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.56481  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.58 
 
 
688 aa  107  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  24.93 
 
 
640 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.51 
 
 
615 aa  106  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8451  peptidase, S9B (dipeptidyl peptidase IV) subfamily  31.44 
 
 
689 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.695642  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.84 
 
 
653 aa  104  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  25.87 
 
 
657 aa  104  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2346  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 
708 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  26.22 
 
 
643 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2431  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.76 
 
 
735 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474543  normal  0.175702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.24 
 
 
656 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.2 
 
 
630 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5023  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.88 
 
 
351 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02946  Dipeptidyl aminopeptidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI80]  28.15 
 
 
906 aa  101  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.7 
 
 
588 aa  101  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5287  Dipeptidyl-peptidase IV  24.05 
 
 
683 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  27.87 
 
 
656 aa  100  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>