More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1985 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  69.43 
 
 		 550 aa  836    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2238  phosphoglucomutase  71.02 
 
 		 550 aa  850    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000108864  hitchhiker  0.00000000164585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2275  phosphoglucomutase  66.14 
 
 		 550 aa  768    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00864716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  56.48 
 
 		 545 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2146  phosphoglucomutase  70.67 
 
 		 550 aa  843    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000239704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  57.71 
 
 		 550 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  56.51 
 
 		 547 aa  663    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2196  phosphoglucomutase  70.85 
 
 		 550 aa  847    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000365433  unclonable  0.00000535585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2332  phosphoglucomutase  65.15 
 
 		 551 aa  752    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90326  hitchhiker  0.000453174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2159  phosphoglucomutase  56.97 
 
 		 547 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260766  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1254  phosphoglucomutase  58.73 
 
 		 546 aa  674    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00445613  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1985  phosphoglucomutase  100 
 
 		 568 aa  1178    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  55.67 
 
 		 549 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  57.09 
 
 		 548 aa  647    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1922  phosphoglucomutase  66.96 
 
 		 559 aa  776    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2031  phosphoglucomutase  69.08 
 
 		 550 aa  834    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00697315  hitchhiker  0.000229027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1944  phosphoglucomutase  69.61 
 
 		 550 aa  839    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370627  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1915  phosphoglucomutase  76.06 
 
 		 547 aa  879    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.061293  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0839  phosphoglucomutase  56.44 
 
 		 548 aa  653    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2056  phosphoglucomutase  68.43 
 
 		 548 aa  806    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  56.91 
 
 		 548 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2134  phosphoglucomutase  69.08 
 
 		 550 aa  833    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.40825  decreased coverage  0.0000149403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1706  phosphoglucomutase  67.9 
 
 		 560 aa  775    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0879  phosphoglucomutase  56.76 
 
 		 550 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0178981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  55.87 
 
 		 547 aa  642    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02553  phosphoglucomutase  55.52 
 
 		 550 aa  657    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246812  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4511  phosphoglucomutase  70.14 
 
 		 550 aa  845    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1882  phosphoglucomutase  70.32 
 
 		 550 aa  848    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00767786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  56.79 
 
 		 548 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000458453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2225  phosphoglucomutase  70.14 
 
 		 550 aa  845    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000344179  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0758  phosphoglucomutase  56.26 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0406624  normal  0.321306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  55.56 
 
 		 548 aa  632  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0745  phosphoglucomutase  56.26 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000133851  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  53.97 
 
 		 547 aa  633  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1581  phosphoglucomutase  57.09 
 
 		 553 aa  629  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2654  phosphoglucomutase  53.18 
 
 		 552 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0855  phosphoglucomutase  56.26 
 
 		 546 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0156964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  55.03 
 
 		 549 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1203  phosphoglucomutase  55.03 
 
 		 546 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  decreased coverage  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0819  phosphoglucomutase  56.26 
 
 		 546 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00834178  normal  0.142423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1212  phosphoglucomutase  55.87 
 
 		 547 aa  623  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000373193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  55.46 
 
 		 547 aa  624  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0806  phosphoglucomutase  56.08 
 
 		 546 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000341822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  55.06 
 
 		 553 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00645  phosphoglucomutase  55.38 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000381568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2949  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  55.38 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0735  phosphoglucomutase  55.38 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0716  phosphoglucomutase  55.38 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000022067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0562  phosphoglucomutase  55.38 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0783  phosphoglucomutase  55.2 
 
 		 546 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00118232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1123  phosphoglucomutase  55.69 
 
 		 547 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0537632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0710  phosphoglucomutase  55.38 
 
 		 546 aa  621  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000485556  normal  0.414307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3793  phosphoglucomutase  54.14 
 
 		 550 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00636  hypothetical protein  55.38 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000314178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3119  phosphoglucomutase  55.69 
 
 		 547 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000194945  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2968  phosphoglucomutase  55.38 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00229066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1671  phosphoglucomutase  53.25 
 
 		 550 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3574  phosphoglucomutase  54.77 
 
 		 547 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2933  phosphoglucomutase  55.34 
 
 		 547 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  55 
 
 		 545 aa  613  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  54.59 
 
 		 547 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3442  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  52.83 
 
 		 547 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  54.98 
 
 		 547 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000232571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  53.82 
 
 		 551 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1099  phosphoglucomutase  54.59 
 
 		 547 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195598  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2029  phosphoglucomutase  55.14 
 
 		 546 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.744455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5043  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  54.09 
 
 		 544 aa  609  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  53.83 
 
 		 547 aa  610  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  53.9 
 
 		 547 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1724  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  51.94 
 
 		 546 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00010492  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1934  phosphoglucomutase  54.96 
 
 		 546 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4039  phosphoglucomutase  53.97 
 
 		 550 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  52.52 
 
 		 550 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1849  phosphoglucomutase  54.61 
 
 		 546 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1330  phosphoglucomutase  52.99 
 
 		 546 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66611  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  53.29 
 
 		 545 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  52.83 
 
 		 545 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  52.83 
 
 		 545 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0168  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  53.25 
 
 		 556 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.839456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  53.24 
 
 		 546 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1950  phosphoglucomutase  51.42 
 
 		 563 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1699  phosphoglucomutase  52.93 
 
 		 551 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0143  phosphoglucomutase  53.2 
 
 		 551 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.104299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13085  phosphoglucomutase  54.05 
 
 		 547 aa  599  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.794041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1728  phosphoglucomutase  52.31 
 
 		 553 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1707  phosphoglucomutase  52.31 
 
 		 553 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1775  phosphoglucomutase  52.31 
 
 		 553 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4406  phosphoglucomutase  52.13 
 
 		 561 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3234  phosphoglucomutase  52.17 
 
 		 553 aa  597  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  52.75 
 
 		 548 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07370  phosphoglucomutase  51.6 
 
 		 546 aa  595  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5639  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  51.15 
 
 		 545 aa  598  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830487  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3191  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  52.29 
 
 		 561 aa  592  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0301219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  52.75 
 
 		 545 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  51.24 
 
 		 550 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0467  phosphoglucomutase  50.35 
 
 		 553 aa  590  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  51.42 
 
 		 549 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4438  phosphoglucomutase  52.39 
 
 		 564 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.293773  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  52.3 
 
 		 548 aa  590  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01060  phosphoglucomutase  53.01 
 
 		 572 aa  587  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>