More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1747 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  100 
 
 
321 aa  653    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  68.45 
 
 
326 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  69.55 
 
 
319 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  69.55 
 
 
319 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  68.91 
 
 
319 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  68.14 
 
 
326 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  69.23 
 
 
319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  65.82 
 
 
331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  65.82 
 
 
331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  68.91 
 
 
319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  68.91 
 
 
319 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  68.91 
 
 
319 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  66.99 
 
 
319 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  64.44 
 
 
318 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  64.38 
 
 
347 aa  435  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  64.35 
 
 
318 aa  435  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  65.11 
 
 
320 aa  435  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  69.23 
 
 
319 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  61.45 
 
 
333 aa  431  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  63.09 
 
 
318 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  63.09 
 
 
318 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  62.78 
 
 
318 aa  428  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  63.84 
 
 
318 aa  427  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  63.41 
 
 
318 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  62.78 
 
 
318 aa  428  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  63.38 
 
 
318 aa  427  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  61.83 
 
 
318 aa  424  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  62.78 
 
 
335 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  62.34 
 
 
318 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  64.15 
 
 
318 aa  425  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  62.46 
 
 
318 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  62.15 
 
 
316 aa  421  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.46 
 
 
318 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  61.95 
 
 
318 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  62.46 
 
 
318 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  62.46 
 
 
318 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  62.46 
 
 
318 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  62.46 
 
 
318 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  62.46 
 
 
318 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  65.71 
 
 
324 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.38 
 
 
356 aa  407  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  59.75 
 
 
319 aa  404  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  60.8 
 
 
323 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  60.44 
 
 
339 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.28 
 
 
325 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  59.2 
 
 
326 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  55.25 
 
 
332 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  56.31 
 
 
325 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  55.31 
 
 
325 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  56.04 
 
 
323 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  54.69 
 
 
321 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  51.24 
 
 
324 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  54.97 
 
 
322 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  54.11 
 
 
319 aa  341  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  49.22 
 
 
320 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  51.25 
 
 
327 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  52.06 
 
 
327 aa  334  1e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.85 
 
 
350 aa  334  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.11 
 
 
329 aa  333  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.02 
 
 
331 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  51.37 
 
 
331 aa  328  6e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.43 
 
 
342 aa  322  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  47.52 
 
 
315 aa  322  5e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  47.17 
 
 
330 aa  322  5e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  51.13 
 
 
328 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  50.94 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  50.31 
 
 
329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  50.62 
 
 
333 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  50.62 
 
 
333 aa  318  6e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.25 
 
 
333 aa  318  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.59 
 
 
317 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  48.43 
 
 
330 aa  315  6e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  48.75 
 
 
333 aa  315  8e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  51.28 
 
 
345 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  49.84 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  51.26 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.43 
 
 
325 aa  312  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.42 
 
 
353 aa  311  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.32 
 
 
329 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.12 
 
 
330 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.12 
 
 
331 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  51.12 
 
 
330 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  49.5 
 
 
340 aa  310  2e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.2 
 
 
332 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  48.25 
 
 
325 aa  308  6.999999999999999e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.94 
 
 
333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 
329 aa  305  7e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.38 
 
 
322 aa  305  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  47.62 
 
 
328 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.78 
 
 
329 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  50.79 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 
327 aa  302  7.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  50.32 
 
 
332 aa  300  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  48.41 
 
 
344 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  51.48 
 
 
371 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  50.32 
 
 
332 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  48.41 
 
 
337 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  48.57 
 
 
339 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.04 
 
 
332 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>