21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0089 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0089  vault protein inter-alpha-trypsin  100 
 
 		 134 aa  270  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  48.36 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  55.66 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0145  hypothetical protein  46.21 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0750  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  31.33 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0743  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000269716  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3036  VanZ family protein  28.43 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000617485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  31.33 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  31.33 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  31.33 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  31.33 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  31.33 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  31.33 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  26.73 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  39.39 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  32.91 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  34.57 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  36.08 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  31.76 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  36.78 
 
 		 1200 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>