20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0357 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0357  TPR domain-containing protein  100 
 
 
234 aa  468  1e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000167049  decreased coverage  9.09482e-09 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0349  TPR repeat-containing protein  98.72 
 
 
234 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0354  TPR repeat-containing protein  97.44 
 
 
234 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0784365  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0347  TPR repeat-containing protein  97.01 
 
 
234 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0393217  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0324  TPR repeat-containing protein  76.39 
 
 
234 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0353  TPR domain-containing protein  81.04 
 
 
232 aa  352  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3619  TPR repeat-containing protein  76.82 
 
 
234 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3816  TPR repeat-containing protein  75.97 
 
 
234 aa  346  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4589  TPR repeat-containing protein  62.01 
 
 
226 aa  277  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  1.95953e-08 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0359  TPR repeat-containing protein  58.05 
 
 
230 aa  253  1e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3504  TPR repeat-containing protein  56.71 
 
 
221 aa  241  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3473  TPR repeat-containing protein  60.7 
 
 
269 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3823  hypothetical protein  35.66 
 
 
228 aa  82.4  5e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6282  hypothetical protein  35.92 
 
 
217 aa  59.7  4e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0309056  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1235  hypothetical protein  37.93 
 
 
215 aa  55.5  7e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0213  hypothetical protein  27.03 
 
 
206 aa  51.2  1e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.33 
 
 
406 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.33 
 
 
406 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.82 
 
 
335 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2147  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.4 
 
 
283 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0794715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>