42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0078 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.72 
 
 		 705 bp  1326    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0646    96.66 
 
 		 995 bp  1780    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.01 
 
 		 909 bp  1647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  99.49 
 
 		 2451 bp  4187    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0818    96.66 
 
 		 995 bp  1780    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.290487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  85.83 
 
 		 2457 bp  757    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  98.24 
 
 		 2451 bp  3973    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  98 
 
 		 2451 bp  3925    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.72 
 
 		 705 bp  1326    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.72 
 
 		 1017 bp  1429    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0078    100 
 
 		 3824 bp  7581    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1017 bp  2016    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.9 
 
 		 1017 bp  2008    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.3 
 
 		 1017 bp  1556    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  94.4 
 
 		 1016 bp  1556    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1017 bp  2016    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0138    86.65 
 
 		 2486 bp  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.3 
 
 		 1017 bp  1556    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2820    90.82 
 
 		 462 bp  525  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2818    89.45 
 
 		 417 bp  478  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3847  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.35 
 
 		 261 bp  450  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.35 
 
 		 261 bp  450  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  86.05 
 
 		 2490 bp  404  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  85.62 
 
 		 2490 bp  389  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  84.6 
 
 		 2487 bp  351  8.999999999999999e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  84.55 
 
 		 2490 bp  349  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  81.3 
 
 		 2055 bp  200  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  79.94 
 
 		 1017 bp  129  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  79.94 
 
 		 1017 bp  129  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  79.94 
 
 		 1017 bp  129  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  79.94 
 
 		 1017 bp  129  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1331  flagellar motor switch protein FliM  95.31 
 
 		 573 bp  103  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1301  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.16 
 
 		 594 bp  93.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000147857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.77 
 
 		 1017 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.77 
 
 		 1017 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.77 
 
 		 1017 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.77 
 
 		 1017 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.77 
 
 		 1017 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.77 
 
 		 1017 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.77 
 
 		 1017 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.77 
 
 		 1017 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1333  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 546 bp  54  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>