23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2820 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2820    100 
 
 		 462 bp  916    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.22 
 
 		 1017 bp  571  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.11 
 
 		 1017 bp  559  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0078    90.82 
 
 		 3824 bp  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.82 
 
 		 1017 bp  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.82 
 
 		 1017 bp  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.82 
 
 		 1017 bp  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.91 
 
 		 909 bp  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  88.76 
 
 		 1016 bp  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  88.28 
 
 		 1017 bp  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0646    86.35 
 
 		 995 bp  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0818    86.35 
 
 		 995 bp  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.290487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.2 
 
 		 705 bp  281  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.2 
 
 		 705 bp  281  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.34 
 
 		 261 bp  155  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3847  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.34 
 
 		 261 bp  155  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3320  hypothetical protein  100 
 
 		 522 bp  77.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4435  hypothetical protein  100 
 
 		 261 bp  77.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1301  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  83.04 
 
 		 594 bp  71.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000147857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  93.33 
 
 		 1017 bp  58  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  93.33 
 
 		 1017 bp  58  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  93.33 
 
 		 1017 bp  58  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  93.33 
 
 		 1017 bp  58  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>