31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0818 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0646    100 
 
 
995 bp  1972    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.86 
 
 
705 bp  1390    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.86 
 
 
705 bp  1390    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0078    96.66 
 
 
3824 bp  1780    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.66 
 
 
1017 bp  1780    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.56 
 
 
1017 bp  1772    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0818    100 
 
 
995 bp  1972    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.290487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.56 
 
 
909 bp  1576    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.86 
 
 
1017 bp  1312    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.92 
 
 
1017 bp  1479    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  92.82 
 
 
1016 bp  1463    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.66 
 
 
1017 bp  1780    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  93.02 
 
 
1017 bp  1487    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3847  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
261 bp  517  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
261 bp  517  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2818    90.17 
 
 
417 bp  502  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2820    86.35 
 
 
462 bp  408  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  84.1 
 
 
1017 bp  141  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  84.1 
 
 
1017 bp  141  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  84.1 
 
 
1017 bp  141  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  84.1 
 
 
1017 bp  141  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1301  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.82 
 
 
594 bp  95.6  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000147857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.22 
 
 
1017 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.22 
 
 
1017 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.22 
 
 
1017 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.22 
 
 
1017 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.22 
 
 
1017 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.22 
 
 
1017 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.22 
 
 
1017 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.22 
 
 
1017 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.11 
 
 
936 bp  52  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>