19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2818 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2818    100 
 
 		 417 bp  827    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  94 
 
 		 1016 bp  628  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92.81 
 
 		 1017 bp  589  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  91.61 
 
 		 1017 bp  549  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.41 
 
 		 1017 bp  509  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0646    90.17 
 
 		 995 bp  502  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0818    90.17 
 
 		 995 bp  502  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.290487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.93 
 
 		 909 bp  494  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.93 
 
 		 705 bp  494  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.93 
 
 		 705 bp  494  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.45 
 
 		 1017 bp  478  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0078    89.45 
 
 		 3824 bp  478  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.45 
 
 		 1017 bp  478  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.45 
 
 		 1017 bp  478  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1301  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  86.49 
 
 		 594 bp  67.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000147857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  83.15 
 
 		 1017 bp  58  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  83.15 
 
 		 1017 bp  58  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  83.15 
 
 		 1017 bp  58  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  83.15 
 
 		 1017 bp  58  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>