48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1822 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1778  hypothetical protein  99.72 
 
 
363 aa  739    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000002473  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1785  hypothetical protein  99.45 
 
 
363 aa  737    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000593436  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1690  hypothetical protein  83.47 
 
 
363 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.165734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1822  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  741    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000314938  normal  0.174335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2500  hypothetical protein  99.45 
 
 
363 aa  737    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000222884  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1575  hypothetical protein  82.37 
 
 
360 aa  620  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156633  normal  0.143123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2878  hypothetical protein  81.82 
 
 
360 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1642  hypothetical protein  82.64 
 
 
360 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.03169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1650  hypothetical protein  81.82 
 
 
359 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00643743  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2163  hypothetical protein  44.35 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1750  hypothetical protein  43.13 
 
 
365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0668546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2442  hypothetical protein  43.39 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.500512  normal  0.0434614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1966  hypothetical protein  43.24 
 
 
370 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000283183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1837  hypothetical protein  44.34 
 
 
376 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421612  normal  0.203773 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1642  hypothetical protein  46.61 
 
 
392 aa  288  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00221365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1917  hypothetical protein  44.67 
 
 
384 aa  279  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100608  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002784  hypothetical protein  27.65 
 
 
402 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3195  hypothetical protein  25.91 
 
 
477 aa  119  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03197  hypothetical protein  28.39 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02147  hypothetical protein  33.51 
 
 
465 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2252  hypothetical protein  26.61 
 
 
358 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2807  hypothetical protein  25.35 
 
 
361 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.157687  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1748  hypothetical protein  26.37 
 
 
382 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.592425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52020  hypothetical protein  28.25 
 
 
345 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203193 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1927  hypothetical protein  22.9 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0266  hypothetical protein  22.9 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1185  hypothetical protein  29.9 
 
 
351 aa  94  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36880  hypothetical protein  27.3 
 
 
334 aa  93.2  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4563  hypothetical protein  28.67 
 
 
363 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0947  hypothetical protein  24.05 
 
 
439 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1070  hypothetical protein  27.16 
 
 
359 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0277153  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3688  hypothetical protein  27.44 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000276179 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2488  hypothetical protein  24.61 
 
 
370 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0895  translation elongation factor G  26.14 
 
 
402 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000943112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2387  hypothetical protein  25.34 
 
 
398 aa  86.3  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0709  hypothetical protein  25.08 
 
 
388 aa  86.7  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1701  hypothetical protein  26.67 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1264  hypothetical protein  26.85 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0640884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1666  hypothetical protein  28.05 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4052  hypothetical protein  28.05 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1634  hypothetical protein  25.29 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.395754  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1224  hypothetical protein  26.4 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.01444  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2995  hypothetical protein  25.74 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.604355  hitchhiker  0.00130055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0970  hypothetical protein  23.17 
 
 
375 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1719  hypothetical protein  27.21 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.604615  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1649  hypothetical protein  27.21 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02242  hypothetical protein  25.69 
 
 
352 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0554  Protein of unknown function DUF2066  21.69 
 
 
365 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>