More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0043 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  311  2e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  311  2e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  311  2e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
151 aa  311  2e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  7.67573e-11 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0045  Rrf2 family protein  94.04 
 
 
151 aa  298  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0041  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  94.04 
 
 
151 aa  299  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0191012  hitchhiker  0.000277794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  93.38 
 
 
151 aa  297  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  93.38 
 
 
151 aa  296  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  8.83142e-07 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0036  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  94.7 
 
 
151 aa  296  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0056  Rrf2 family protein  80.67 
 
 
151 aa  259  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0941015  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4881  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  80 
 
 
152 aa  258  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  78.67 
 
 
150 aa  256  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.209804  normal  0.479131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4474  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  79.33 
 
 
151 aa  254  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.99058e-08  hitchhiker  2.96889e-09 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  75.17 
 
 
149 aa  243  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  74.17 
 
 
151 aa  241  2e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3702  hypothetical protein  66.23 
 
 
151 aa  215  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.72 
 
 
175 aa  144  4e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  46.76 
 
 
143 aa  138  2e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.61 
 
 
145 aa  137  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.14 
 
 
141 aa  136  8e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  47.14 
 
 
141 aa  136  8e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  47.14 
 
 
141 aa  136  8e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  45.71 
 
 
141 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  47.14 
 
 
141 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.62 
 
 
156 aa  135  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.86 
 
 
143 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  46.43 
 
 
141 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  46.43 
 
 
141 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  46.43 
 
 
141 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  46.81 
 
 
141 aa  134  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  2.82304e-08 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  46.43 
 
 
141 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  46.43 
 
 
141 aa  134  6e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  46.43 
 
 
141 aa  134  6e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  46.43 
 
 
141 aa  134  6e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  1.29464e-06 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  46.43 
 
 
141 aa  134  6e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46.43 
 
 
141 aa  134  6e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  47.86 
 
 
141 aa  133  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  46.81 
 
 
162 aa  132  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  46.81 
 
 
162 aa  132  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  45.71 
 
 
141 aa  133  1e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  47.86 
 
 
141 aa  132  2e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  45.71 
 
 
154 aa  132  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  45.71 
 
 
154 aa  132  2e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  47.14 
 
 
141 aa  130  4e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.71 
 
 
147 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.36 
 
 
147 aa  130  8e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002267  nitrite-sensitive transcriptional repressor NsrR  47.86 
 
 
141 aa  129  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.45 
 
 
150 aa  128  2e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.15 
 
 
156 aa  129  2e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.45 
 
 
162 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.45 
 
 
150 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  43.24 
 
 
147 aa  126  8e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  43.75 
 
 
157 aa  126  1e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.75 
 
 
157 aa  126  1e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.44 
 
 
160 aa  126  1e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.86 
 
 
147 aa  125  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1523  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.44 
 
 
181 aa  125  2e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.41 
 
 
159 aa  125  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00086  transcriptional repressor NsrR  47.14 
 
 
141 aa  125  2e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  45.71 
 
 
141 aa  124  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.46 
 
 
140 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  46.27 
 
 
172 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.67 
 
 
146 aa  124  4e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.66 
 
 
146 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.67 
 
 
159 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.57 
 
 
151 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  44.76 
 
 
143 aa  123  8e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  44.76 
 
 
143 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.38 
 
 
163 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  42 
 
 
150 aa  120  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.28 
 
 
166 aa  120  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.28 
 
 
166 aa  118  2e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.43 
 
 
147 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.93 
 
 
156 aa  117  4e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.36 
 
 
145 aa  117  5e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  41.26 
 
 
153 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0640  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.6 
 
 
149 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3383  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.6 
 
 
155 aa  112  2e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.44 
 
 
163 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.58 
 
 
172 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  110  8e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.36 
 
 
149 aa  110  8e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.43 
 
 
159 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.31 
 
 
171 aa  109  1e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.67 
 
 
165 aa  109  1e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.23 
 
 
154 aa  108  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1327  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.19 
 
 
168 aa  108  4e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679067  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.67 
 
 
171 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.67 
 
 
171 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.67 
 
 
171 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.31 
 
 
172 aa  106  9e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1131  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.06 
 
 
144 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.99 
 
 
166 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1534  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.06 
 
 
144 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353948  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2888  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.06 
 
 
144 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.3 
 
 
166 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  40.6 
 
 
162 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  40.6 
 
 
165 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  40.6 
 
 
162 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  35.81 
 
 
175 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>