More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0711 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
308 aa  630  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 
308 aa  630  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  55.66 
 
 
308 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  34.65 
 
 
310 aa  201  1e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.31 
 
 
307 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  35.76 
 
 
328 aa  197  2e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.98 
 
 
307 aa  197  2e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.23465e-05 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.76 
 
 
305 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  35.31 
 
 
307 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.43 
 
 
318 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.98 
 
 
307 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78714e-14 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.98 
 
 
320 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.98 
 
 
307 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  34.98 
 
 
307 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  29.86 
 
 
296 aa  133  4e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  29.86 
 
 
296 aa  133  4e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  29.71 
 
 
640 aa  129  9e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  28.62 
 
 
293 aa  125  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  29.47 
 
 
400 aa  125  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  25.93 
 
 
402 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  27.99 
 
 
320 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  27.05 
 
 
356 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  27.67 
 
 
395 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  27.3 
 
 
415 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  27.33 
 
 
395 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  27 
 
 
395 aa  117  2e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  27.21 
 
 
527 aa  117  2e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  28.76 
 
 
320 aa  116  4e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  27.33 
 
 
395 aa  116  4e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  28.92 
 
 
346 aa  116  4e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  26.67 
 
 
395 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  28.15 
 
 
400 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  28.15 
 
 
400 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  27 
 
 
395 aa  115  7e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  25.62 
 
 
401 aa  115  7e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  26.67 
 
 
395 aa  115  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  26.07 
 
 
403 aa  115  1e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  24.4 
 
 
415 aa  115  1e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  26.01 
 
 
335 aa  115  1e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  27.04 
 
 
349 aa  114  2e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  25.31 
 
 
400 aa  114  2e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  25.85 
 
 
400 aa  114  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  25.07 
 
 
376 aa  114  2e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  24.68 
 
 
401 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  24.36 
 
 
377 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  28.3 
 
 
320 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  29.81 
 
 
313 aa  112  7e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  24.61 
 
 
406 aa  112  1e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  23.9 
 
 
405 aa  111  1e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  24.23 
 
 
406 aa  111  1e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  26.82 
 
 
332 aa  111  2e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.92 
 
 
402 aa  111  2e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  27.1 
 
 
329 aa  111  2e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  28.25 
 
 
303 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  27.1 
 
 
328 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  27.1 
 
 
328 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  26.71 
 
 
407 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  24.84 
 
 
397 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  27.98 
 
 
349 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  31.11 
 
 
316 aa  109  7e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 
319 aa  109  7e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  24.86 
 
 
417 aa  109  8e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  27.14 
 
 
309 aa  108  9e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  24.76 
 
 
423 aa  108  9e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  24.05 
 
 
402 aa  108  9e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.25 
 
 
319 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  25 
 
 
406 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.11 
 
 
316 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  28.09 
 
 
341 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  24.05 
 
 
402 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  24.46 
 
 
406 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  26.34 
 
 
336 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  24.75 
 
 
394 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  23.38 
 
 
424 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  23.73 
 
 
402 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.11 
 
 
316 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  26.15 
 
 
354 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  31.11 
 
 
316 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.11 
 
 
316 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  23.2 
 
 
373 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  25 
 
 
401 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  23.25 
 
 
410 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.74 
 
 
316 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  25.91 
 
 
407 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30.51 
 
 
319 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  26.46 
 
 
354 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  23.4 
 
 
393 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  22.88 
 
 
401 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  24.13 
 
 
423 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  23.71 
 
 
396 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  24.1 
 
 
433 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  24.13 
 
 
423 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  24.44 
 
 
402 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  27.41 
 
 
322 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  24.75 
 
 
394 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.74 
 
 
316 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.7 
 
 
355 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  25.85 
 
 
354 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.7 
 
 
358 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  24.91 
 
 
352 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>