More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0899 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
368 aa  745    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  79.45 
 
 
366 aa  586  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  76.23 
 
 
368 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.18 
 
 
359 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.18 
 
 
359 aa  408  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.57 
 
 
388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.25 
 
 
363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.06 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.66 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.94 
 
 
357 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.04 
 
 
347 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.88 
 
 
355 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.72 
 
 
357 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.66 
 
 
368 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.06 
 
 
345 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.59 
 
 
356 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.41 
 
 
348 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.7 
 
 
348 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.66 
 
 
349 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.47 
 
 
361 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.13 
 
 
355 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.35 
 
 
348 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.07 
 
 
359 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.94 
 
 
349 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.53 
 
 
349 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.36 
 
 
357 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.93 
 
 
369 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.24 
 
 
358 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.31 
 
 
356 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.98 
 
 
349 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.29 
 
 
355 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.18 
 
 
356 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.59 
 
 
357 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55 
 
 
345 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.06 
 
 
353 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.91 
 
 
355 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.84 
 
 
345 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.89 
 
 
357 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.33 
 
 
346 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.98 
 
 
357 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.77 
 
 
355 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.65 
 
 
363 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.56 
 
 
353 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.62 
 
 
345 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.48 
 
 
355 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.3 
 
 
341 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.53 
 
 
346 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.88 
 
 
345 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.24 
 
 
348 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.16 
 
 
345 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.76 
 
 
348 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.14 
 
 
379 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.46 
 
 
357 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.38 
 
 
352 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.21 
 
 
357 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.07 
 
 
358 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.69 
 
 
357 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.3 
 
 
347 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.3 
 
 
347 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.35 
 
 
350 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.3 
 
 
347 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55 
 
 
345 aa  362  8e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.17 
 
 
348 aa  362  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.59 
 
 
350 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  51.7 
 
 
802 aa  361  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.59 
 
 
350 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.09 
 
 
352 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.59 
 
 
345 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.59 
 
 
345 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.59 
 
 
345 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.76 
 
 
346 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.25 
 
 
348 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.1 
 
 
345 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.82 
 
 
345 aa  359  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.87 
 
 
346 aa  358  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.29 
 
 
345 aa  358  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.48 
 
 
348 aa  358  9e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.65 
 
 
345 aa  358  9e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.06 
 
 
348 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.51 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.51 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.8 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.75 
 
 
346 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.51 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.98 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.19 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.41 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.98 
 
 
345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.84 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.41 
 
 
363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.22 
 
 
359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.98 
 
 
345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.57 
 
 
346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  54.98 
 
 
345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.98 
 
 
345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.98 
 
 
345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.98 
 
 
345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.41 
 
 
352 aa  356  3.9999999999999996e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.98 
 
 
348 aa  355  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.68 
 
 
345 aa  355  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>