More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4610 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  62.7 
 
 
507 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  65.61 
 
 
498 aa  637    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  80.16 
 
 
505 aa  819    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  95.25 
 
 
505 aa  969    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  75.75 
 
 
517 aa  791    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  76.49 
 
 
510 aa  781    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  75.84 
 
 
510 aa  803    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  80.79 
 
 
505 aa  824    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  77.03 
 
 
505 aa  787    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  100 
 
 
505 aa  1037    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  94.85 
 
 
505 aa  967    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  75.84 
 
 
510 aa  803    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  77.03 
 
 
505 aa  788    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  81.35 
 
 
505 aa  849    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  75.64 
 
 
506 aa  766    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  76.04 
 
 
510 aa  803    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  63.69 
 
 
504 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  61.39 
 
 
505 aa  619  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  62.43 
 
 
504 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  61.63 
 
 
506 aa  613  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  59.8 
 
 
505 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  60.79 
 
 
504 aa  611  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  60.36 
 
 
505 aa  608  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  58.45 
 
 
503 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  61.03 
 
 
498 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  62.62 
 
 
503 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  60.4 
 
 
504 aa  598  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  60.44 
 
 
499 aa  596  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  58.76 
 
 
505 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  63.65 
 
 
496 aa  591  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  61.07 
 
 
505 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  60.16 
 
 
499 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  60.59 
 
 
504 aa  594  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  57.23 
 
 
514 aa  591  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  60.64 
 
 
509 aa  587  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  57.65 
 
 
499 aa  584  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  58.65 
 
 
499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  60.56 
 
 
510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  58.27 
 
 
509 aa  579  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  58.85 
 
 
499 aa  580  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  57.85 
 
 
504 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  58.03 
 
 
505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  57.49 
 
 
501 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.42 
 
 
496 aa  570  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  60.04 
 
 
501 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  57.97 
 
 
500 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  60.04 
 
 
501 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  60.76 
 
 
502 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  59.64 
 
 
501 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.82 
 
 
496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  58.76 
 
 
497 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  54.14 
 
 
513 aa  551  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  54.33 
 
 
510 aa  552  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  54.08 
 
 
497 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  57.31 
 
 
507 aa  549  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  54.27 
 
 
498 aa  546  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  57.11 
 
 
507 aa  544  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  57.11 
 
 
505 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  56.57 
 
 
507 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  52.56 
 
 
513 aa  539  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  56.2 
 
 
499 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  58 
 
 
500 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  53.2 
 
 
494 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  57.34 
 
 
514 aa  534  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  56.11 
 
 
522 aa  534  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  52.17 
 
 
527 aa  528  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  52.19 
 
 
489 aa  526  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  51.39 
 
 
500 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  51.2 
 
 
500 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  52.81 
 
 
501 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  52.59 
 
 
502 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1472  glycerol kinase  51.97 
 
 
510 aa  520  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  52.81 
 
 
502 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1128  glycerol kinase  53.7 
 
 
523 aa  521  1e-146  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  52.19 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  52.19 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  52.19 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  52.19 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  52.39 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  50.6 
 
 
496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  50.8 
 
 
496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  52.4 
 
 
499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  52.39 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1800  glycerol kinase  51.37 
 
 
532 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal  0.482844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  52.39 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  50.8 
 
 
496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  52.39 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  52.6 
 
 
499 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  52.19 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  53.66 
 
 
505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  52.19 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  52.19 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  50.6 
 
 
496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  52.19 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  50.6 
 
 
496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  50.4 
 
 
498 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  50.4 
 
 
498 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  53.4 
 
 
498 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  50.2 
 
 
496 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  51.67 
 
 
497 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>