More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1301 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
162 aa  338  3e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  95.6 
 
 
161 aa  320  7e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  93.08 
 
 
161 aa  294  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  78.53 
 
 
163 aa  273  1e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  81.29 
 
 
163 aa  271  2e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  82.58 
 
 
164 aa  270  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  77.3 
 
 
163 aa  269  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  76.69 
 
 
163 aa  268  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  77.78 
 
 
162 aa  269  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  80 
 
 
162 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  79.75 
 
 
167 aa  268  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  81.94 
 
 
164 aa  267  3e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  79.38 
 
 
162 aa  268  3e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  78.75 
 
 
162 aa  268  3e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  77.3 
 
 
163 aa  267  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  80 
 
 
162 aa  267  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  77.3 
 
 
163 aa  266  6e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  82.58 
 
 
164 aa  266  9e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  78.12 
 
 
162 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  78.48 
 
 
167 aa  265  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  77.5 
 
 
162 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  75.31 
 
 
163 aa  265  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  78.12 
 
 
162 aa  265  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  76.54 
 
 
162 aa  265  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  78.48 
 
 
167 aa  265  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  77.3 
 
 
163 aa  265  3e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  75.93 
 
 
162 aa  264  3e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  78.12 
 
 
162 aa  264  3e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  76.07 
 
 
163 aa  265  3e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  77.3 
 
 
163 aa  264  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  77.5 
 
 
162 aa  263  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  79.22 
 
 
167 aa  263  8e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  77.5 
 
 
162 aa  262  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  76.88 
 
 
162 aa  261  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  76.88 
 
 
162 aa  261  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  76.88 
 
 
162 aa  261  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  76.25 
 
 
162 aa  258  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  73.46 
 
 
164 aa  256  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  80.54 
 
 
163 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  76.92 
 
 
162 aa  253  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  5.73568e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  75 
 
 
162 aa  253  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  74.23 
 
 
163 aa  251  4e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  75.5 
 
 
169 aa  247  4e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  75.97 
 
 
163 aa  245  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  70.19 
 
 
169 aa  242  2e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  76.39 
 
 
167 aa  240  7e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  74.53 
 
 
224 aa  235  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  68.32 
 
 
226 aa  233  6e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  76.03 
 
 
273 aa  233  9e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  67.9 
 
 
165 aa  223  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  72 
 
 
160 aa  222  2e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  66.67 
 
 
163 aa  222  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  67.48 
 
 
163 aa  221  5e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  65.43 
 
 
165 aa  218  2e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  65.43 
 
 
162 aa  218  2e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  67.31 
 
 
181 aa  217  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  63.58 
 
 
162 aa  214  3e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
165 aa  214  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  63.58 
 
 
162 aa  214  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  63.58 
 
 
162 aa  214  6e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  64.81 
 
 
162 aa  213  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  63.52 
 
 
163 aa  213  1e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  66.04 
 
 
163 aa  212  2e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  62.26 
 
 
163 aa  212  2e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  66.04 
 
 
163 aa  212  2e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  66.04 
 
 
163 aa  212  2e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  61.73 
 
 
162 aa  211  3e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  65.43 
 
 
163 aa  211  3e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  66.45 
 
 
161 aa  211  4e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  66.67 
 
 
169 aa  209  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  66.67 
 
 
163 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  61.11 
 
 
162 aa  208  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  66.67 
 
 
170 aa  207  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  66.04 
 
 
170 aa  206  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  63.58 
 
 
165 aa  205  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  64.2 
 
 
162 aa  204  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  62.58 
 
 
168 aa  203  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  64.2 
 
 
162 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  64.2 
 
 
162 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  64.2 
 
 
162 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  62.58 
 
 
163 aa  202  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
162 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  63.58 
 
 
162 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  63.58 
 
 
162 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  63.58 
 
 
162 aa  201  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  66.03 
 
 
177 aa  201  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
162 aa  201  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
162 aa  199  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
162 aa  199  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
162 aa  199  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
162 aa  199  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  64.15 
 
 
163 aa  199  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
162 aa  199  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
162 aa  199  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  62.35 
 
 
162 aa  199  1e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  61.04 
 
 
163 aa  199  1e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  3.91532e-05 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  61.04 
 
 
163 aa  199  1e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2697  NADH dehydrogenase subunit I  61.88 
 
 
166 aa  197  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0277  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
162 aa  197  4e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.587133  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0248  NADH dehydrogenase subunit I  62.96 
 
 
162 aa  197  4e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>