240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1088 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  86.36 
 
 		 66 aa  115  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  81.82 
 
 		 66 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  80.3 
 
 		 66 aa  105  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1279  50S ribosomal protein L35P  61.54 
 
 		 65 aa  79  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.686056  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 		 66 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1442  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1240  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000491229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  44.62 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  50.88 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  40.91 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  52.73 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2171  ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000338785  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  52.73 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  43.33 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  49.15 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>