29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2934 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  100 
 
 		 827 aa  1673    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  90.21 
 
 		 827 aa  1522    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000708466  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  71.41 
 
 		 823 aa  1163    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  90.08 
 
 		 827 aa  1520    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000777581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  62.86 
 
 		 832 aa  1019    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000305835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  71.82 
 
 		 828 aa  1192    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000331771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  90.08 
 
 		 827 aa  1520    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000160154  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  88.27 
 
 		 824 aa  1440    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000022798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  74.13 
 
 		 828 aa  1234    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  90.33 
 
 		 827 aa  1527    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000315404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2120  hypothetical protein  71.67 
 
 		 826 aa  1159    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000487086  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  92.03 
 
 		 828 aa  1521    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  0.00000000514631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2571  hypothetical protein  74.19 
 
 		 829 aa  1135    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  91.79 
 
 		 828 aa  1518    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  92.74 
 
 		 827 aa  1542    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  67.3 
 
 		 839 aa  1117    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  41.75 
 
 		 866 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  32.71 
 
 		 856 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  30.74 
 
 		 872 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  29.17 
 
 		 796 aa  224  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  27.32 
 
 		 826 aa  201  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  27.47 
 
 		 802 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  27.06 
 
 		 993 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  27.18 
 
 		 939 aa  75.1  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0034  hypothetical protein  28.42 
 
 		 975 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0036  hypothetical protein  26.23 
 
 		 982 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0048  hypothetical protein  25.74 
 
 		 982 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0033  hypothetical protein  25.17 
 
 		 982 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  27.37 
 
 		 832 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>