More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1835 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 
444 aa  870    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  89.39 
 
 
444 aa  790    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  89.39 
 
 
444 aa  790    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  61.26 
 
 
441 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  63.29 
 
 
441 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  63.51 
 
 
441 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  63.51 
 
 
441 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  63.29 
 
 
441 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  63.29 
 
 
441 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  63.29 
 
 
441 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  63.29 
 
 
441 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  63.29 
 
 
441 aa  548  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.06 
 
 
441 aa  548  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  63.06 
 
 
441 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.61 
 
 
441 aa  542  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.59 
 
 
441 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2302  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.95 
 
 
431 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00748681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.94 
 
 
435 aa  464  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.89 
 
 
431 aa  435  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.55 
 
 
438 aa  427  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0499  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.54 
 
 
444 aa  418  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000767859  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.88 
 
 
455 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1865  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.32 
 
 
436 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000195925  hitchhiker  0.00000000000416015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.22 
 
 
452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.19 
 
 
433 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.74 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.41 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.99 
 
 
460 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.38 
 
 
440 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.51 
 
 
433 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.26 
 
 
431 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.49 
 
 
431 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.26 
 
 
441 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  47.52 
 
 
431 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.8 
 
 
431 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  46.94 
 
 
430 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  47.3 
 
 
431 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.95 
 
 
433 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.8 
 
 
431 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  44.9 
 
 
429 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.8 
 
 
429 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.67 
 
 
429 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  44.57 
 
 
430 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.89 
 
 
429 aa  365  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.48 
 
 
430 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.21 
 
 
431 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.12 
 
 
431 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  43.44 
 
 
429 aa  363  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.58 
 
 
436 aa  362  6e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  44.98 
 
 
431 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.21 
 
 
429 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.21 
 
 
429 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.99 
 
 
429 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  43.89 
 
 
429 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.9 
 
 
441 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
429 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  45.91 
 
 
430 aa  359  5e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.14 
 
 
429 aa  359  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  47.18 
 
 
429 aa  358  7e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  46.95 
 
 
429 aa  359  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 
429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  45.89 
 
 
494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.34 
 
 
437 aa  356  5e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.53 
 
 
429 aa  356  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.02 
 
 
431 aa  356  5e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.75 
 
 
429 aa  356  5.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  45.68 
 
 
430 aa  356  5.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.92 
 
 
432 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.35 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.75 
 
 
431 aa  353  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.89 
 
 
431 aa  353  4e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0804  xanthine/uracil permease family protein  44.22 
 
 
433 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.85 
 
 
430 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0911  xanthine/uracil permease family protein  44.22 
 
 
433 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0817  xanthine/uracil permease family protein  43.99 
 
 
433 aa  350  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0711  xanthine/uracil permease family protein  43.99 
 
 
433 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000785311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0662  xanthine/uracil permease family protein  43.99 
 
 
433 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0654  xanthine/uracil permease family protein  43.99 
 
 
433 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000506416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0747  xanthine/uracil permease family protein  43.99 
 
 
433 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.237802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0823  xanthine/uracil permease family protein  43.99 
 
 
433 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8721299999999997e-52 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
465 aa  349  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4526  xanthine/uracil permease family protein  44.22 
 
 
433 aa  349  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.190363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.39 
 
 
454 aa  349  7e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3356  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.76 
 
 
433 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000349173  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0441  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.98 
 
 
446 aa  348  9e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.783527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0172  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.15 
 
 
451 aa  348  1e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000522834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0666  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.76 
 
 
433 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0631  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.72 
 
 
433 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000126006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  41.86 
 
 
429 aa  346  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.99 
 
 
467 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.9 
 
 
471 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  41.44 
 
 
445 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  41.44 
 
 
445 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  41.44 
 
 
445 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  41.44 
 
 
445 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  41.53 
 
 
449 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.89 
 
 
433 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>