57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0551 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0551  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0963  hypothetical protein  68.59 
 
 
191 aa  280  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0982  hypothetical protein  68.59 
 
 
191 aa  280  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  32.6 
 
 
197 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  32.6 
 
 
197 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  32.6 
 
 
197 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  32.6 
 
 
197 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  32.6 
 
 
197 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  32.6 
 
 
197 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  32.6 
 
 
197 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  32.6 
 
 
197 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  32.6 
 
 
197 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  29.5 
 
 
206 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.41 
 
 
207 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  32.6 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  21.69 
 
 
724 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  20.59 
 
 
746 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  21.32 
 
 
732 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  21.32 
 
 
732 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  21.32 
 
 
732 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  25.9 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  23.12 
 
 
714 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  21.59 
 
 
235 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  21.59 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  21.59 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  21.59 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  21.59 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  21.59 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  21.59 
 
 
235 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  22.37 
 
 
728 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  21.59 
 
 
235 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.7 
 
 
722 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  24.26 
 
 
739 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  24.26 
 
 
739 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  22.73 
 
 
713 aa  44.7  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  23.08 
 
 
720 aa  44.7  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  21.59 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  24.6 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  24.62 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  24.84 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  23.84 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  20 
 
 
714 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  19.74 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  15.51 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  21.71 
 
 
728 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  26.74 
 
 
716 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  23.94 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  25.66 
 
 
252 aa  42.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.13 
 
 
267 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  23.85 
 
 
714 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  18.02 
 
 
217 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  23.16 
 
 
236 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  24.84 
 
 
239 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  22.52 
 
 
735 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  25.38 
 
 
238 aa  41.2  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  21.52 
 
 
738 aa  41.2  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>