More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2455 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 
398 aa  820    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  67.61 
 
 
404 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.15 
 
 
409 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  59.59 
 
 
407 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  61.62 
 
 
385 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  60.31 
 
 
395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.09 
 
 
395 aa  448  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.04 
 
 
394 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.84 
 
 
393 aa  438  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  53.12 
 
 
453 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.25 
 
 
453 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.54 
 
 
402 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.56 
 
 
452 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  51.17 
 
 
400 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  51.04 
 
 
454 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  52.34 
 
 
382 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  52.04 
 
 
404 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.09 
 
 
399 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  52.31 
 
 
461 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  49.48 
 
 
402 aa  368  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.66 
 
 
466 aa  360  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.78 
 
 
396 aa  352  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.44 
 
 
396 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.25 
 
 
414 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.59 
 
 
442 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  46.95 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.83 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.57 
 
 
386 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.01 
 
 
395 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  43.26 
 
 
392 aa  316  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.78 
 
 
397 aa  312  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.49 
 
 
384 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.56 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.99 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.6 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.21 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.96 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.3 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.27 
 
 
386 aa  301  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0739  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42 
 
 
411 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.28 
 
 
392 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
392 aa  299  6e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.82 
 
 
393 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.67 
 
 
386 aa  298  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.36 
 
 
387 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.56 
 
 
419 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.54 
 
 
408 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.81 
 
 
396 aa  296  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 
392 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.69 
 
 
392 aa  296  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.95 
 
 
393 aa  296  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.57 
 
 
399 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.16 
 
 
396 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.15 
 
 
397 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  43.12 
 
 
396 aa  288  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  41.15 
 
 
385 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  41.15 
 
 
385 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.62 
 
 
415 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.47 
 
 
404 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  40.85 
 
 
430 aa  286  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.04 
 
 
385 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  40.26 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.73 
 
 
391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.3 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02900  acyl-CoA dehydrogenase  41.56 
 
 
402 aa  282  8.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  39.69 
 
 
391 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.6 
 
 
397 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.145534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2005  glutaryl-CoA dehydrogenase  40.8 
 
 
395 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5749  glutaryl-CoA dehydrogenase  40.78 
 
 
387 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.312995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.62 
 
 
386 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0711  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.86 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245364  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.32 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3322  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  40.1 
 
 
408 aa  273  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.02 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017739  normal  0.388373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3906  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.34 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2451  glutaryl-CoA dehydrogenase  37.4 
 
 
404 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0706  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.73 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0694  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.34 
 
 
395 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.28 
 
 
389 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0782  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.08 
 
 
395 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05840  glutaryl-CoA dehydrogenase  38.02 
 
 
393 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.53 
 
 
394 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.64 
 
 
394 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.36 
 
 
386 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.83 
 
 
376 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0419  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.38 
 
 
395 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3904  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  38.34 
 
 
396 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.83 
 
 
376 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0776  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.08 
 
 
396 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.567358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0549  glutaryl-CoA dehydrogenase  38.02 
 
 
393 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0117  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.76 
 
 
393 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0899419  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5068  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 
393 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000324963  normal  0.0231586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0330  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.08 
 
 
395 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0813  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.08 
 
 
395 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0158  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  hitchhiker  0.0000982042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  37.66 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0177  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00130576  normal  0.936713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3170  glutaryl-CoA dehydrogenase  37.86 
 
 
422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1734  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.95 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.177428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>