More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1971 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  100 
 
 
416 aa  805    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  32.18 
 
 
452 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  32.68 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  31.42 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  35.88 
 
 
428 aa  159  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  28.41 
 
 
451 aa  149  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  31.69 
 
 
428 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  31.63 
 
 
420 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  26.28 
 
 
432 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  30.05 
 
 
428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  30.79 
 
 
414 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  33.33 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  31.36 
 
 
421 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  32.81 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  30.9 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  31.9 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  30.27 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  28.47 
 
 
432 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  31.41 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  28.8 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  33.95 
 
 
428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.33 
 
 
444 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  29.14 
 
 
466 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.86 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.98 
 
 
442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.33 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.27 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  30.88 
 
 
428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0371  chlorohydrolase  27.57 
 
 
405 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0102343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  26.14 
 
 
431 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  29.49 
 
 
461 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  30.15 
 
 
656 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  24.76 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  30.29 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.88 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  25.98 
 
 
431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.33 
 
 
443 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  29.22 
 
 
443 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  29.95 
 
 
442 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  28.18 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  31.53 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  32.84 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  25.06 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  31.38 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.27 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  29.16 
 
 
441 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  34.15 
 
 
368 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  30.92 
 
 
440 aa  117  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  31.67 
 
 
432 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4080  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.04 
 
 
444 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.55583  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.59 
 
 
439 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  30.09 
 
 
445 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.27 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.71 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.27 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  32.58 
 
 
478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  26.93 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  29.33 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  31.75 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  30.65 
 
 
663 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  29.47 
 
 
435 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.89 
 
 
434 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  29.47 
 
 
435 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  26.04 
 
 
469 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  24.76 
 
 
398 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  27.36 
 
 
435 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  27.99 
 
 
660 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  31.71 
 
 
460 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  28.61 
 
 
435 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  29.09 
 
 
435 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  29.09 
 
 
435 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.29 
 
 
444 aa  113  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  29.09 
 
 
435 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  29.09 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  29.09 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.86 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  33.06 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  29.76 
 
 
440 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.75 
 
 
445 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3238  amidohydrolase  30.17 
 
 
444 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.43 
 
 
446 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  30.08 
 
 
424 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.19 
 
 
431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  30.8 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  25.97 
 
 
444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  25.14 
 
 
428 aa  110  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  30.42 
 
 
440 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  30.2 
 
 
457 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  25.79 
 
 
434 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.66 
 
 
442 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  30.4 
 
 
462 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  25.59 
 
 
428 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  27.03 
 
 
408 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0758  amidohydrolase  26.22 
 
 
442 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  26.43 
 
 
462 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.75 
 
 
453 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.25 
 
 
448 aa  107  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.84 
 
 
441 aa  107  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.86 
 
 
441 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  31.83 
 
 
473 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>