46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1118 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 
263 aa  541  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  50.34 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  50 
 
 
216 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  51.05 
 
 
195 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  42.93 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  38.89 
 
 
270 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  46.48 
 
 
217 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  47.92 
 
 
218 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  39.02 
 
 
207 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  37.38 
 
 
354 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  27.23 
 
 
293 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  34.26 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.18 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  25.31 
 
 
292 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  26.83 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  36.27 
 
 
350 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  26.97 
 
 
220 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  29.93 
 
 
192 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  31.47 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  31.65 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  36.26 
 
 
210 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  36.26 
 
 
210 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  36.26 
 
 
210 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  36.26 
 
 
210 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  36.26 
 
 
210 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  36.26 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  36.26 
 
 
210 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  36.26 
 
 
210 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  25.25 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  36.26 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.87 
 
 
344 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  35.16 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  30.77 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  27.89 
 
 
316 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  34.44 
 
 
253 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  34.07 
 
 
210 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  23.51 
 
 
307 aa  47  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  30.83 
 
 
384 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.07 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  29.17 
 
 
291 aa  45.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  34.12 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  28.57 
 
 
377 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  34.72 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  35.71 
 
 
298 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  25 
 
 
337 aa  43.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  26.89 
 
 
395 aa  42.7  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>