More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1062 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
486 aa  995    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  96.71 
 
 
487 aa  966    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  83.09 
 
 
497 aa  840    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  96.71 
 
 
487 aa  967    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  83.47 
 
 
508 aa  843    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  84.33 
 
 
499 aa  854    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  60.08 
 
 
502 aa  599  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  60.59 
 
 
486 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  57.26 
 
 
488 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  60.99 
 
 
490 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  59.87 
 
 
493 aa  585  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  60.47 
 
 
517 aa  581  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  60.52 
 
 
496 aa  578  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  59.1 
 
 
503 aa  571  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  59.87 
 
 
501 aa  565  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  59.23 
 
 
499 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  58.8 
 
 
491 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  59.01 
 
 
491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  59.01 
 
 
500 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  57.17 
 
 
514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  58.8 
 
 
491 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  59.44 
 
 
491 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  57.63 
 
 
509 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  58.8 
 
 
491 aa  557  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  57.85 
 
 
514 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  57.26 
 
 
500 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  58.67 
 
 
510 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  57.51 
 
 
503 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  58.71 
 
 
514 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  55.7 
 
 
496 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  56.66 
 
 
496 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  55.27 
 
 
496 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  55.39 
 
 
529 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  55.35 
 
 
496 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
496 aa  523  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  56.03 
 
 
504 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  55.39 
 
 
504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  57.29 
 
 
485 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  56.78 
 
 
509 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
476 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
468 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
477 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  51.32 
 
 
466 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  52.13 
 
 
493 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
477 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
475 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
467 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
474 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  48.58 
 
 
474 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  51.07 
 
 
481 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  53.07 
 
 
485 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  51.07 
 
 
475 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  52.97 
 
 
485 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  52.97 
 
 
485 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  52.42 
 
 
484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 
461 aa  467  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  47.64 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
482 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
451 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
511 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 
480 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
461 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
465 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  47.94 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  47.29 
 
 
472 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  49.58 
 
 
500 aa  448  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  47.2 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
496 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  48.3 
 
 
495 aa  444  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
471 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
466 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
471 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0194  amidophosphoribosyltransferase  46.61 
 
 
463 aa  437  1e-121  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0142686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  47.03 
 
 
470 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
471 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  46.42 
 
 
467 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  47.03 
 
 
488 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  44.33 
 
 
475 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
470 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
506 aa  432  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
462 aa  435  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  45.42 
 
 
484 aa  431  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  45.8 
 
 
473 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  45.8 
 
 
473 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  46.89 
 
 
493 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  46.22 
 
 
487 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
446 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
484 aa  426  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  45.79 
 
 
474 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  46.86 
 
 
482 aa  428  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  47.23 
 
 
502 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  47.49 
 
 
488 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>