More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2417 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  59.85 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  64.83 
 
 		 258 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  61.09 
 
 		 264 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  58.3 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  56.76 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.52 
 
 		 270 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  56.76 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  58.58 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  55.04 
 
 		 259 aa  295  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  58.3 
 
 		 266 aa  293  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  54.65 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  58.3 
 
 		 266 aa  293  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  53.49 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  56.39 
 
 		 270 aa  292  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  60.59 
 
 		 262 aa  292  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  57.94 
 
 		 270 aa  289  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  58.78 
 
 		 281 aa  288  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  54.37 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  57.09 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  56.87 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  56.34 
 
 		 270 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  58.12 
 
 		 257 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  54.89 
 
 		 271 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  56.15 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  56.15 
 
 		 266 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  54.24 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  56.32 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  54.24 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  60.09 
 
 		 266 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  56.79 
 
 		 281 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  51.53 
 
 		 258 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.79 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.79 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.79 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.79 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  52.67 
 
 		 268 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  59.32 
 
 		 265 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.79 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  54.66 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  56.79 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  52.4 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  52.4 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  52.4 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  55.65 
 
 		 529 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  56.38 
 
 		 272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  52.03 
 
 		 271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  56.38 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  54.81 
 
 		 268 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  55.97 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  52.97 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  55.84 
 
 		 260 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  53.56 
 
 		 268 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  53.56 
 
 		 268 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.91 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.91 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  48.48 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.91 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  52.87 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  52.87 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2868  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.32 
 
 		 266 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  54.79 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.75 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2978  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.32 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  51.46 
 
 		 259 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.91 
 
 		 297 aa  261  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2929  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.32 
 
 		 266 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  51.46 
 
 		 259 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  54.41 
 
 		 264 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  55.65 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  52.46 
 
 		 268 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  56.78 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  56.02 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  52.3 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0412  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.32 
 
 		 259 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  57.2 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0217  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.32 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2556  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.32 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0932  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.32 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  51.05 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  56.78 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  56.78 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  50.85 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  52.77 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  56.18 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  56.18 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  54.17 
 
 		 263 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.94 
 
 		 271 aa  255  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  55.04 
 
 		 260 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  49.79 
 
 		 286 aa  254  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  53.31 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.58 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.58 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.58 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.58 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.58 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  54.98 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.98 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.98 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  50 
 
 		 269 aa  251  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>