More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4114 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  100 
 
 		 288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4336  pyridoxal kinase  58.33 
 
 		 303 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  47.79 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  47.79 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  47.79 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  47.79 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  47.79 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  47.06 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  47.43 
 
 		 283 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  46.69 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  46.69 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  48.34 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2671  pyridoxal kinase  48.71 
 
 		 288 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.122398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  48.34 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  48.34 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  47.97 
 
 		 288 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  46.49 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2566  pyridoxal kinase  44.53 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4211  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.21 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0105657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  38.43 
 
 		 288 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  39.54 
 
 		 287 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  36.78 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  39.92 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  37.55 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  37.26 
 
 		 289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  35.83 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  34.7 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01187  pyridoxal kinase  41.35 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0980044  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  36.5 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  33.58 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  33.88 
 
 		 271 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  33.21 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37680  Pyridoxal kinase  38.1 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  37.4 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  32.84 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  33.21 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  33.21 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  33.21 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  32.84 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  33.21 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  33.21 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  33.21 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  32.45 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  31.7 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  34.22 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  32.08 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  32.08 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  32.32 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  32.32 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  32.08 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  32.08 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  30.42 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  33.46 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  31.7 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  35.25 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  33.33 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  32.84 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  33.46 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  32.84 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  30.42 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  32.46 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  32.2 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  32.84 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  33.33 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  32.84 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  32.47 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  37.45 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  32.1 
 
 		 354 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  30.8 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2802  pyridoxal kinase  32.47 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  33.08 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  30.57 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  31.44 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  34.96 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  32.09 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  34.96 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  30.6 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  28.9 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  30.48 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  30.04 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2138  pyridoxal kinase  31.72 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0688  pyridoxal kinase  32.09 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2881  pyridoxal kinase  32.28 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1167  pyridoxal kinase  32.09 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  34.93 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  31.34 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  31.34 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  31.44 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  32.7 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1143  pyridoxal kinase  31.72 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  35.32 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  33.58 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  31.94 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  31.94 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  34.7 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  32.2 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  30.08 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  32.18 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  33.21 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  34.08 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>