284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2373 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  70.11 
 
 
556 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  73.43 
 
 
558 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  66.18 
 
 
555 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  64.79 
 
 
554 aa  706    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2303  hypothetical protein  69.86 
 
 
1496 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  69.49 
 
 
555 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  67.57 
 
 
556 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.93 
 
 
556 aa  751    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  62.43 
 
 
557 aa  696    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  70.11 
 
 
556 aa  752    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  63.6 
 
 
554 aa  708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  69.37 
 
 
551 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  69.18 
 
 
559 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  64.25 
 
 
554 aa  704    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1139    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  67.75 
 
 
556 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  69.18 
 
 
559 aa  744    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  67.75 
 
 
556 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  61.66 
 
 
557 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  62.57 
 
 
567 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6238  hypothetical protein  67.39 
 
 
556 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5350  hypothetical protein  75.63 
 
 
396 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.723811  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  53.16 
 
 
539 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0079  hypothetical protein  70.27 
 
 
417 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0072  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.17 
 
 
423 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245934  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0069  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.23 
 
 
422 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000464578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0053  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.23 
 
 
422 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000634616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0069  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.97 
 
 
422 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0106574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0109  hypothetical protein  67.73 
 
 
417 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0378  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.97 
 
 
421 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1682  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  59.33 
 
 
427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3458  hypothetical protein  56.53 
 
 
414 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2918  hypothetical protein  59.74 
 
 
411 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0799  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.36 
 
 
413 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34330  hypothetical protein  59.74 
 
 
411 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00153013  normal  0.203445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1542  putative transmembrane protein  57.88 
 
 
421 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1939  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.25 
 
 
425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.746538  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2006  putative oxidoreductase  51.76 
 
 
418 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.94 
 
 
418 aa  438  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2576  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.14 
 
 
404 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581088  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.37 
 
 
401 aa  394  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  47.29 
 
 
422 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.815625  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.46 
 
 
396 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2352  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.21 
 
 
395 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.128946  normal  0.129463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1831  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.36 
 
 
400 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.436589 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2915  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.09 
 
 
399 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.11 
 
 
400 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438506  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.11 
 
 
399 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3630  sulfide quinone oxidoreductase-like protein  48.24 
 
 
421 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.217473  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.11 
 
 
399 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5690  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.11 
 
 
399 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2891  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.37 
 
 
401 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0986  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.01 
 
 
398 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1961  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48 
 
 
401 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209751  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.89 
 
 
397 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0075  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.89 
 
 
397 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2712  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.09 
 
 
400 aa  346  7e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.862127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3633  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.3 
 
 
396 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.315982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.57 
 
 
395 aa  342  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0708248  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.93 
 
 
426 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.379311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3524  hypothetical protein  39.45 
 
 
399 aa  323  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2276  hypothetical protein  40.2 
 
 
399 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2337  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.2 
 
 
399 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2551  hypothetical protein  39.95 
 
 
399 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.30285e-28 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08346  conserved hypothetical protein  41.01 
 
 
442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3237  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.61 
 
 
400 aa  313  7.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1731  hypothetical protein  39.2 
 
 
399 aa  312  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000598467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2360  hypothetical protein  38.94 
 
 
399 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.204751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2537  hypothetical protein  38.94 
 
 
399 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0495125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3042  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.9 
 
 
398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3958  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase-like protein  43.59 
 
 
372 aa  296  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.203323 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01825  conserved hypothetical protein  38.06 
 
 
487 aa  293  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.75293 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2318  hypothetical protein  39.64 
 
 
330 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000211189  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03140  Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial precursor, putative  40.11 
 
 
458 aa  265  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.98 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169709  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.25 
 
 
489 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53579  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2082  twin-arginine translocation pathway signal  32.96 
 
 
491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.32 
 
 
449 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.809961  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2526  putative sulfide quinone-rductase  37.41 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.149353 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1665  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.01 
 
 
461 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4021  hypothetical protein  36.5 
 
 
450 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1034  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.26 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3497  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.17 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20580  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  31.66 
 
 
401 aa  219  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1051  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.31 
 
 
390 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0344  sulfide-quinone reductase  32.59 
 
 
403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0355  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.59 
 
 
403 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0365  sulfide-quinone reductase  32.59 
 
 
403 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.44 
 
 
438 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0928  twin-arginine translocation pathway signal  36.5 
 
 
436 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2307  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 
451 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00993475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0624  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.29 
 
 
413 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0441404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1203  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.91 
 
 
413 aa  150  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.223151  normal  0.0279723 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1846  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.86 
 
 
413 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.75 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0069  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  27.29 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0223  oxidoreductase, putative  24.09 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1554  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.86 
 
 
408 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.138705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  43.7 
 
 
142 aa  127  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0165  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.76 
 
 
379 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.934981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>