More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2968 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  96.62 
 
 
414 aa  772  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
414 aa  811  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  73.88 
 
 
421 aa  616  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  71.53 
 
 
412 aa  572  1e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  56.11 
 
 
406 aa  425  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  47.06 
 
 
428 aa  381  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 
408 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  47.87 
 
 
405 aa  352  8e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 
408 aa  332  8e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  44.61 
 
 
426 aa  326  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  42.2 
 
 
405 aa  309  6e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  44.44 
 
 
419 aa  305  1e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  42.96 
 
 
406 aa  303  5e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
407 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  40.65 
 
 
422 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  40.16 
 
 
421 aa  285  1e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
428 aa  284  2e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  43.07 
 
 
399 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 
406 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  39.9 
 
 
419 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  37.89 
 
 
424 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  41.92 
 
 
406 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  41.92 
 
 
406 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  39.8 
 
 
412 aa  263  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 
430 aa  260  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 
401 aa  254  2e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  38.54 
 
 
415 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 
398 aa  239  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  38.62 
 
 
434 aa  234  2e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
397 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  38.33 
 
 
424 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  38.33 
 
 
399 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  38.33 
 
 
424 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  36.48 
 
 
405 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  35.28 
 
 
397 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  35.42 
 
 
436 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  38.54 
 
 
415 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  36.82 
 
 
395 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  34.46 
 
 
411 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 
427 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.52958e-05  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  36.18 
 
 
397 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  35.75 
 
 
418 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  33.43 
 
 
401 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  33.73 
 
 
426 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.11783e-05  unclonable  7.56922e-10 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0789  major facilitator transporter  33.51 
 
 
412 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  35.85 
 
 
397 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  35.85 
 
 
397 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  33.93 
 
 
428 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  4.34229e-07  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  33.66 
 
 
395 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  35.9 
 
 
399 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  35.9 
 
 
399 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  35.9 
 
 
399 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  31.38 
 
 
411 aa  189  6e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0271  major facilitator transporter  35.73 
 
 
429 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 
411 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.09307e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1794  multidrug resistance protein  35.47 
 
 
429 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0121  multidrug resistance protein  35.47 
 
 
429 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1708  multidrug resistance protein  35.47 
 
 
429 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.477199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1290  multidrug resistance protein  35.47 
 
 
429 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.800676  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1119  multidrug resistance protein  35.47 
 
 
429 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0305  multidrug resistance protein  35.47 
 
 
429 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  32.98 
 
 
408 aa  184  4e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  30.59 
 
 
411 aa  183  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  33.16 
 
 
396 aa  182  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  30.61 
 
 
411 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1444  major facilitator transporter  39.67 
 
 
413 aa  180  5e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 
402 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  31.79 
 
 
391 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49750  MFS family transporter  36.91 
 
 
422 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.93 
 
 
417 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
434 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
389 aa  165  1e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  33.7 
 
 
412 aa  162  8e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  32.17 
 
 
416 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  33.79 
 
 
414 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  33.07 
 
 
411 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  31.58 
 
 
413 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.52 
 
 
414 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  34.98 
 
 
386 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  34.39 
 
 
398 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
392 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.24014e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
439 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 
398 aa  154  3e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 
398 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  34.13 
 
 
435 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  30.06 
 
 
407 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.14988e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  32.12 
 
 
396 aa  149  1e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
387 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.58317e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
423 aa  146  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.38 
 
 
416 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  32.5 
 
 
419 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
424 aa  134  2e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  27.61 
 
 
424 aa  135  2e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  30.45 
 
 
370 aa  135  2e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  28.09 
 
 
444 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 
421 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1598  transporter, major facilitator superfamily and tetracycline resistance protein  28.65 
 
 
366 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  31.93 
 
 
417 aa  129  8e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
425 aa  128  2e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  28.78 
 
 
416 aa  126  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>