More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0083 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0083  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  100 
 
 
358 aa  734  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869567  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0066  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  90.76 
 
 
357 aa  672  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  decreased coverage  0.00876972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0073  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  68.68 
 
 
370 aa  511  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17760  putative methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  60.58 
 
 
357 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1546  putative methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  60.35 
 
 
357 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.939179  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0889  ada regulatory protein, putative  56.86 
 
 
350 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0833  putative ada regulatory protein  56.57 
 
 
350 aa  404  1e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1438  methylated-DNA--protein- cysteinemethyltransferase  57.06 
 
 
357 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2682  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  57.71 
 
 
354 aa  400  1e-110  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100688  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3288  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  55.01 
 
 
351 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0019  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  53.06 
 
 
360 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0849  ADA regulatory protein  50.74 
 
 
351 aa  355  8e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0286  hypothetical protein  44.78 
 
 
352 aa  318  1e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0450605 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1152  hypothetical protein  48.07 
 
 
356 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1745  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  42.12 
 
 
351 aa  315  1e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00607574  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1156  hypothetical protein  47.18 
 
 
356 aa  314  2e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1108  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  43.36 
 
 
348 aa  312  5e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  9.71871e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2158  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  47.51 
 
 
360 aa  306  5e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0128  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  41.94 
 
 
361 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0045  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  41.94 
 
 
348 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.218349  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0234  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  39.12 
 
 
354 aa  240  3e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2282  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
345 aa  179  5e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2323  ADA regulatory protein  35.28 
 
 
364 aa  179  6e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  1.61007e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0132  ADA regulatory protein  35.28 
 
 
364 aa  179  6e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2836  ADA regulatory protein  35.28 
 
 
364 aa  179  6e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  9.94394e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0115  ADA regulatory protein  35.28 
 
 
364 aa  179  6e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  3.93468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2249  ADA regulatory protein  35.28 
 
 
364 aa  179  6e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  2.55362e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2300  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  35.28 
 
 
364 aa  179  6e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000121844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0322  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  35 
 
 
364 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.61378e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0116  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  35 
 
 
364 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.27978e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0085  ADA regulatory protein  35.75 
 
 
364 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  9.11419e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3089  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
363 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  3.81417e-07  hitchhiker  0.0021619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6508  bifunctional DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  35.06 
 
 
363 aa  175  1e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.3299e-08  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3205  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 
380 aa  174  2e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  4.0374e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3145  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 
365 aa  174  2e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.98948e-08  unclonable  6.12342e-12 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2432  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  50.77 
 
 
196 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.514175  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2396  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  32.66 
 
 
343 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0834  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  34.93 
 
 
340 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3152  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
363 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  4.75647e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2539  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
363 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  5.7895e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3171  AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
363 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  7.19173e-08  decreased coverage  1.35353e-07 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2118  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 
366 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0669009  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1437  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
354 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02140  fused DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  34.28 
 
 
354 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02099  hypothetical protein  34.28 
 
 
354 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.592554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1445  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 
354 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.29559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0476  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  31.82 
 
 
361 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0383  ada regulatory protein  32.68 
 
 
361 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0727  regulatory protein Ada  33.71 
 
 
354 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.166972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2938  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
357 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0368  ada regulatory protein  32.02 
 
 
361 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4835  transcriptional regulator, AraC family  34.68 
 
 
360 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179003  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2362  regulatory protein Ada  33.71 
 
 
354 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960218  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2512  regulatory protein Ada  33.71 
 
 
354 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0107303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4134  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
354 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0607807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2352  regulatory protein Ada  33.71 
 
 
354 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.970088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3351  regulatory protein Ada  33.43 
 
 
354 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.212963  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1042  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
370 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.826547  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0082  ada regulatory protein  32.56 
 
 
354 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3088  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
376 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  1.18536e-07  hitchhiker  7.98373e-14 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3365  methylated-DNA-[protein]-cysteine S-methyltransferase  33.05 
 
 
384 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3595  Ada regulatory protein  31.84 
 
 
368 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3955  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 
391 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.56521e-05  normal  0.830157 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2491  regulatory protein ada  33.15 
 
 
353 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1536  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 
366 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.26366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1027  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 
359 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2608  regulatory protein ada  32.87 
 
 
352 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.669578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0793  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 
376 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0138198  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2505  regulatory protein ada  33.15 
 
 
352 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  hitchhiker  0.000630655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2449  regulatory protein ada  33.15 
 
 
352 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0458356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2401  regulatory protein ada  33.15 
 
 
352 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00982046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1307  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 
357 aa  149  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4482  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
401 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.21745e-09  unclonable  1.5212e-06 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4931  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 
354 aa  146  4e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4239  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  29.8 
 
 
353 aa  146  7e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.577797  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0501  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 
374 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0740  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
350 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2570  bifunctional methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase/O-6-methylguanine-DNA transcription regulator  31.98 
 
 
360 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2450  transcriptional regulator, AraC family  31.7 
 
 
361 aa  139  9e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0739  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  32.1 
 
 
350 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0969  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  48.24 
 
 
193 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0366  methylated-DNA (protein)-cysteine S-methyltransferase  43.9 
 
 
231 aa  137  3e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.902899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2793  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  32.49 
 
 
354 aa  137  3e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.986339  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1283  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  27.25 
 
 
344 aa  137  3e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4318  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  32.38 
 
 
380 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2856  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 
361 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3551  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 
369 aa  136  7e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0783013  normal  0.874169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  33.43 
 
 
358 aa  135  1e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1127  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  33.15 
 
 
351 aa  135  1e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.836162  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4687  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 
361 aa  135  1e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6249  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  33.61 
 
 
388 aa  134  2e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0486  methylated-DNA--protein-cysteine S-methyltransferase  37.87 
 
 
175 aa  134  2e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0706  adaptive response regulator protein  31.75 
 
 
350 aa  134  2e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998073  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2924  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  43.31 
 
 
162 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4477  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 
350 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3549  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  41.18 
 
 
166 aa  132  1e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4074  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  43.1 
 
 
170 aa  132  1e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1028  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  47.5 
 
 
204 aa  131  2e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01312  O-6-alkylguanine-DNA:cysteine-protein methyltransferase  41.46 
 
 
171 aa  130  4e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1031  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  47.5 
 
 
204 aa  130  4e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>