More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0048 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  46.11 
 
 
756 aa  649  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50182e-07 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  71.87 
 
 
754 aa  1083  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  46.71 
 
 
759 aa  644  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  49.26 
 
 
773 aa  692  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  80.59 
 
 
764 aa  1243  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0029  malic enzyme  84.89 
 
 
761 aa  1298  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  3.28842e-05 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  46.43 
 
 
779 aa  645  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  63.44 
 
 
753 aa  909  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  50.88 
 
 
749 aa  718  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  46.8 
 
 
759 aa  651  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  46.93 
 
 
759 aa  652  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  46.8 
 
 
759 aa  650  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  46.8 
 
 
759 aa  651  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  46.71 
 
 
759 aa  644  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  47.55 
 
 
766 aa  642  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  46.58 
 
 
759 aa  644  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  46.13 
 
 
756 aa  656  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  5.55006e-10 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  60.24 
 
 
752 aa  926  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  47.32 
 
 
759 aa  657  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  51.95 
 
 
752 aa  721  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.0152e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  47.53 
 
 
763 aa  664  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  46.73 
 
 
759 aa  652  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1298  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP+)  70.3 
 
 
440 aa  639  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  46.84 
 
 
759 aa  635  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  60.54 
 
 
760 aa  918  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  48.46 
 
 
757 aa  653  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  46.11 
 
 
756 aa  650  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  46.22 
 
 
756 aa  651  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  63.81 
 
 
761 aa  953  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  59.84 
 
 
758 aa  880  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  64.13 
 
 
762 aa  977  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  45.77 
 
 
756 aa  647  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  60.75 
 
 
751 aa  917  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  45.77 
 
 
756 aa  647  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  45.77 
 
 
756 aa  647  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  45.77 
 
 
756 aa  647  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  60.35 
 
 
751 aa  933  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  45.77 
 
 
756 aa  647  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  46.73 
 
 
764 aa  655  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  45.77 
 
 
756 aa  647  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  45.64 
 
 
776 aa  646  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  48.67 
 
 
751 aa  678  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  53.02 
 
 
780 aa  755  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  50.2 
 
 
749 aa  736  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  45.79 
 
 
759 aa  646  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  45.66 
 
 
759 aa  645  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  46.73 
 
 
759 aa  652  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  45.79 
 
 
759 aa  645  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  100 
 
 
761 aa  1550  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  47.52 
 
 
766 aa  659  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2959  malic enzyme  51.21 
 
 
749 aa  707  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  46.01 
 
 
757 aa  666  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2471  malic protein NAD-binding protein  48.54 
 
 
751 aa  652  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  47.38 
 
 
755 aa  670  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  48.65 
 
 
764 aa  643  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  45.79 
 
 
759 aa  646  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  47.79 
 
 
754 aa  680  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  50.6 
 
 
758 aa  689  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  46.85 
 
 
761 aa  660  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  4.48619e-08 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  49.39 
 
 
771 aa  715  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1525  malic enzyme  48.93 
 
 
750 aa  654  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.875693  normal  0.0504681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1729  malic enzyme  47.53 
 
 
763 aa  637  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  73.95 
 
 
763 aa  1136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  46.51 
 
 
759 aa  646  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  46.65 
 
 
759 aa  648  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  46.65 
 
 
759 aa  648  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  52.08 
 
 
752 aa  742  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  45.45 
 
 
760 aa  640  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  7.07391e-09 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  46.86 
 
 
759 aa  653  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  45.86 
 
 
761 aa  642  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  1.77126e-06 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  46.15 
 
 
756 aa  650  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  9.441e-06 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  48.94 
 
 
771 aa  682  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  50.94 
 
 
749 aa  711  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  49.07 
 
 
771 aa  667  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  50.47 
 
 
758 aa  687  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  97.37 
 
 
761 aa  1489  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  46.8 
 
 
759 aa  650  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  46.65 
 
 
759 aa  648  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  46.65 
 
 
759 aa  648  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  50.2 
 
 
749 aa  733  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  52.62 
 
 
779 aa  749  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  74.47 
 
 
763 aa  1142  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  46.01 
 
 
757 aa  654  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  60.78 
 
 
754 aa  926  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  45.77 
 
 
756 aa  649  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  60.32 
 
 
751 aa  909  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  56.89 
 
 
763 aa  871  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  46.4 
 
 
777 aa  636  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  66.58 
 
 
753 aa  1009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  49.13 
 
 
771 aa  682  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  59.68 
 
 
754 aa  867  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  45.77 
 
 
756 aa  647  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  45.45 
 
 
760 aa  642  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0420  malic enzyme  47.44 
 
 
750 aa  643  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  56.68 
 
 
758 aa  868  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  61.96 
 
 
754 aa  905  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  49.87 
 
 
752 aa  739  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  45.77 
 
 
773 aa  648  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  46.11 
 
 
756 aa  650  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  60.35 
 
 
759 aa  932  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>