58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3442 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  100 
 
 
237 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  91.95 
 
 
237 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  72.69 
 
 
235 aa  295  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  61.8 
 
 
243 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  70.21 
 
 
250 aa  275  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  63.52 
 
 
242 aa  267  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  62.34 
 
 
237 aa  261  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  62.34 
 
 
237 aa  261  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  48.68 
 
 
239 aa  227  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  45.89 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  45.45 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  46.32 
 
 
239 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  42.19 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  40.51 
 
 
246 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  44.35 
 
 
238 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  40.17 
 
 
249 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  41.18 
 
 
250 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  45.22 
 
 
238 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  40.93 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  40.09 
 
 
248 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  38.49 
 
 
247 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  41.63 
 
 
233 aa  151  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  38.7 
 
 
226 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  39.04 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  43.06 
 
 
240 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  36.82 
 
 
227 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  38.78 
 
 
231 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  34.17 
 
 
230 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  33.47 
 
 
230 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  36.17 
 
 
237 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  31.56 
 
 
236 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  30.97 
 
 
230 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  34.39 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  35.77 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  27.43 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  25.53 
 
 
256 aa  48.9  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  25.25 
 
 
253 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  25.25 
 
 
253 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  25.25 
 
 
253 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  25.25 
 
 
253 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  25.25 
 
 
253 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  25.25 
 
 
253 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  25.25 
 
 
253 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  25.25 
 
 
253 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  24.75 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  27.75 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  27.75 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  27.75 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  27.75 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  27.75 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  23.84 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  27.17 
 
 
253 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  25.35 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  25 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  29.45 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  29.08 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4674  putative sulfate transport protein CysZ  24.86 
 
 
246 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>