35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2691 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  68.72 
 
 
241 aa  316  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  68.28 
 
 
241 aa  315  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  69.16 
 
 
239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  69.7 
 
 
238 aa  299  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  70.09 
 
 
238 aa  275  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  45.31 
 
 
251 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  44.4 
 
 
250 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  45.89 
 
 
247 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  44.59 
 
 
248 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  45.26 
 
 
246 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  45.26 
 
 
246 aa  178  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  44.59 
 
 
249 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  41.7 
 
 
242 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  41.28 
 
 
237 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  47.3 
 
 
237 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  45.26 
 
 
243 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  40.85 
 
 
237 aa  165  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  41.63 
 
 
237 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  45.45 
 
 
231 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  39.3 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  41.26 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  42.41 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  49.52 
 
 
240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  41.63 
 
 
237 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  42.24 
 
 
250 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  33.93 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  30.77 
 
 
230 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  32.02 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  30.77 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  32.02 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  36.05 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  30.9 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  32.43 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  30.3 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>