35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0349 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  100 
 
 		 247 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  90.61 
 
 		 248 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  89.75 
 
 		 249 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  77.82 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  75.51 
 
 		 246 aa  367  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  75.51 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  70.16 
 
 		 250 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  45.89 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  44.59 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  44.16 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  44.02 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  47.62 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  42.31 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  39.66 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  44.31 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  43.29 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  43.29 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  43.29 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  41.28 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  44.07 
 
 		 235 aa  148  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  47.83 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  42.92 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  35.8 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  35.29 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  41.26 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  37.71 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  34.89 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  33.76 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  34.17 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  35.02 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  34.18 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  30.64 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  30.45 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  30.81 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>