35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0441 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  100 
 
 		 251 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  78.54 
 
 		 246 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  77.33 
 
 		 246 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  79.84 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  78.95 
 
 		 249 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  73.98 
 
 		 250 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  77.82 
 
 		 247 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  44.4 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  44 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  46.86 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  45.31 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  42.68 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  45.73 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  45.73 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  45.12 
 
 		 242 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  43.95 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  41.03 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  41.35 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  47.73 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  41.94 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  40.93 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  45.22 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  36.86 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  37.66 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  40.34 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  42.27 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  32.92 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  35.02 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  34.71 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  42.76 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  34.8 
 
 		 230 aa  92  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  31.17 
 
 		 236 aa  92  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  31.12 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  32.26 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  30.32 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>