62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3414 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  100 
 
 
250 aa  477  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  70.21 
 
 
237 aa  314  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  71.12 
 
 
237 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  69.87 
 
 
235 aa  290  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  63.79 
 
 
243 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  60.41 
 
 
242 aa  262  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  63.2 
 
 
237 aa  261  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  63.2 
 
 
237 aa  261  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  45.49 
 
 
239 aa  203  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  39.84 
 
 
250 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  45.69 
 
 
241 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  45.26 
 
 
241 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  46.32 
 
 
238 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  40.34 
 
 
246 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  45.83 
 
 
239 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  39.66 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  40.34 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  37.71 
 
 
248 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  37.71 
 
 
249 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  38.24 
 
 
247 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  44.59 
 
 
238 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  40.95 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  47.13 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  38.96 
 
 
226 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  46.54 
 
 
240 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  40.71 
 
 
231 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  41.61 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  35.44 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  35.44 
 
 
230 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  36.33 
 
 
237 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  36.8 
 
 
227 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  32.64 
 
 
236 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  33.19 
 
 
230 aa  99.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  31.98 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  31.21 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  24.86 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  25.73 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  25.73 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  25.73 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  25.73 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  25.73 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  25.73 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  25.73 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  25.73 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  25.15 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  24.5 
 
 
263 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4674  putative sulfate transport protein CysZ  27.75 
 
 
246 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  24.86 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53330  putative sulfate transport protein CysZ  26.59 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.442824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  24.72 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  25.43 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  25.43 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  25.43 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  29.41 
 
 
244 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  25.43 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  25.43 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  29.31 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  22.86 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0819  putative sulfate transport protein CysZ  28.32 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3267  protein of unknown function DUF540  26.97 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  24.71 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0808  putative sulfate transport protein CysZ  28.74 
 
 
242 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00684995  normal  0.0715554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>