36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2628 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  57.52 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  55.16 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  55.16 
 
 		 230 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  52.99 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  54.42 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  39.08 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  36.68 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  32.5 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  38.1 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  31.65 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  30.74 
 
 		 250 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  31.17 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  34.23 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  32.67 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  31.06 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  30.47 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  30.47 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  31.3 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  29.44 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  31.3 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  30.38 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  31.03 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  30.17 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  33.73 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  34.1 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  31.91 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  32.17 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  37.5 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  34.86 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  32.2 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  31.05 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  32.06 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5501  protein of unknown function DUF540  27.87 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000395042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  32.45 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>