45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2176 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  440  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  41.26 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  41.26 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  39.83 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  43.46 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  39.08 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  40.44 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  29.8 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  33.33 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  32.68 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  33.55 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  29.69 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  32.26 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  30.72 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  34.23 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  32.89 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  33.54 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  34.67 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  36.81 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  34.46 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  34.69 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  29.41 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  29.41 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  32.18 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  34.03 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  32.43 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  35.42 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  32.64 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  32.64 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  34.03 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  27.23 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  30.3 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  32.14 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  25 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  27.31 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  27.31 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  27.31 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4936  protein of unknown function DUF540  28.07 
 
 		 262 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0550253  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  27.73 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  27.73 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  27.73 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  27.73 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  27.73 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>