More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3678 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  67.34 
 
 		 498 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  65.93 
 
 		 498 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  75.25 
 
 		 497 aa  779    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1023  glycerol kinase  77.42 
 
 		 498 aa  755    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  78.23 
 
 		 498 aa  798    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  66.13 
 
 		 498 aa  677    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3678  glycerol kinase  100 
 
 		 496 aa  1006    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  79.64 
 
 		 497 aa  815    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0602  glycerol kinase  77.23 
 
 		 506 aa  760    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  77.82 
 
 		 497 aa  787    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  79.23 
 
 		 498 aa  806    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2324  glycerol kinase  74.95 
 
 		 511 aa  756    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  70.42 
 
 		 499 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  75.35 
 
 		 497 aa  781    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  63.77 
 
 		 496 aa  629  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  62.15 
 
 		 520 aa  624  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  62.47 
 
 		 496 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  56.16 
 
 		 496 aa  616  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  62.16 
 
 		 505 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  56.36 
 
 		 496 aa  615  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  60.73 
 
 		 496 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  58.94 
 
 		 497 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  61.34 
 
 		 496 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  59.67 
 
 		 497 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  57.35 
 
 		 505 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  59.55 
 
 		 497 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  57.76 
 
 		 499 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  57.55 
 
 		 499 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  57.35 
 
 		 503 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  58.37 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  57.35 
 
 		 503 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  57.35 
 
 		 518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  57.35 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  56.73 
 
 		 500 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  56.19 
 
 		 497 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  57.35 
 
 		 518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  57.35 
 
 		 518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  57.35 
 
 		 518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  57.35 
 
 		 518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  60.08 
 
 		 516 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  56.73 
 
 		 500 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  61.15 
 
 		 510 aa  601  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  56.53 
 
 		 500 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  56.33 
 
 		 500 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  56.33 
 
 		 500 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  57.96 
 
 		 513 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  56.33 
 
 		 500 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  58.62 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  59.18 
 
 		 496 aa  593  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  58.86 
 
 		 498 aa  588  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  54.99 
 
 		 498 aa  591  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  56.42 
 
 		 498 aa  588  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  57 
 
 		 495 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  56.28 
 
 		 494 aa  585  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  60.73 
 
 		 497 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  55.47 
 
 		 501 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  55.78 
 
 		 497 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  56.21 
 
 		 498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  56.01 
 
 		 501 aa  582  1.0000000000000001e-165  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  56.65 
 
 		 507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  55.69 
 
 		 493 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  54.77 
 
 		 495 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  55.38 
 
 		 495 aa  581  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  54.73 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  57.58 
 
 		 501 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  55.69 
 
 		 494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  54.12 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  55.69 
 
 		 494 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  55.49 
 
 		 494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  55.49 
 
 		 494 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  54.42 
 
 		 507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  54.88 
 
 		 494 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  55.87 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  54.66 
 
 		 499 aa  568  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  54.67 
 
 		 494 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  54.67 
 
 		 494 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  54.88 
 
 		 494 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  53.25 
 
 		 494 aa  565  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  52.54 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  55.8 
 
 		 496 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  54.29 
 
 		 507 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  52.54 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  52.54 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  54.29 
 
 		 507 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  54.29 
 
 		 507 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  56.19 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  52.74 
 
 		 496 aa  568  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  52.74 
 
 		 496 aa  568  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  52.64 
 
 		 494 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  54.47 
 
 		 494 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  52.54 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  52.54 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  57.09 
 
 		 499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  56.97 
 
 		 498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  52.54 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  52.23 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  55.98 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  52.54 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  54.69 
 
 		 503 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  54.25 
 
 		 499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>