27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1416 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  77.29 
 
 		 263 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  44.31 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  40 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  31.15 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  28.81 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2913  LmbE family protein  28.39 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821813  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  33.62 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  34.02 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  29.86 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  28.96 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  28.96 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  29.74 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2070  hypothetical protein  30.65 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  27.47 
 
 		 235 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4392  hypothetical protein  29.44 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.45148  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  29.73 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  30.27 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  29.65 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6453  LmbE family protein  31.69 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1376  hypothetical protein  31.69 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3426  LmbE family protein  34.47 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00141665  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6045  LmbE family protein  31.15 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.048617  normal  0.182794 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5449  LmbE family protein  31.36 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070373 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  30.28 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  31.17 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.12 
 
 		 218 aa  42  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>