61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1695 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1695  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.782082  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0328  SH3 type 3 domain-containing protein  96.55 
 
 		 186 aa  321  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.213392  normal  0.64697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2552  SH3 type 3 domain-containing protein  64.67 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.58 
 
 		 616 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2431  SH3, type 3  40.91 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0552  SH3, type 3  40.32 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  44.44 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  25.16 
 
 		 564 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  25.16 
 
 		 564 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  25.16 
 
 		 564 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 575 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  25.16 
 
 		 564 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  25.31 
 
 		 564 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  31.96 
 
 		 459 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0462  SH3 type 3 domain-containing protein  36.08 
 
 		 1751 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5468 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.71 
 
 		 751 aa  45.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  25 
 
 		 577 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  35 
 
 		 418 aa  45.1  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 420 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  37.5 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  38.6 
 
 		 426 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  36.51 
 
 		 578 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  38.6 
 
 		 420 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 426 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5360  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 420 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  38.71 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  37.5 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  37.5 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 420 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  37.5 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4920  enterotoxin/cell wall-binding protein  37.5 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  38.6 
 
 		 420 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4935  enterotoxin/cell wall-binding protein  37.5 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  35.71 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  38.6 
 
 		 432 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  38.6 
 
 		 413 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  38.71 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  38.1 
 
 		 582 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 430 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.59 
 
 		 907 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  38.6 
 
 		 579 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  37.31 
 
 		 582 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  40.35 
 
 		 280 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  39.66 
 
 		 582 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.66 
 
 		 580 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  38.6 
 
 		 341 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  39.66 
 
 		 598 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.94 
 
 		 476 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3773  3D domain-containing protein  39.29 
 
 		 284 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  30.65 
 
 		 440 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  30.65 
 
 		 440 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  30.65 
 
 		 524 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  30.16 
 
 		 488 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 		 382 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  31.67 
 
 		 524 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5364  hypothetical protein  33.93 
 
 		 292 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  32.2 
 
 		 548 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  40 
 
 		 147 aa  41.6  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0830  SH3 type 3 domain protein  37.93 
 
 		 108 aa  41.2  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000124614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  40.35 
 
 		 377 aa  41.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>