184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0060 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0060  flagellar switch protein FliM  100 
 
 		 323 aa  658    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0400125  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1695  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 323 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000545109 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1648  surface presentation of antigens (SPOA) protein  93.81 
 
 		 323 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1458  flagellar motor switch protein FliM  32.19 
 
 		 331 aa  179  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  33.02 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  29.81 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  30.19 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  29.49 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  29.49 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  28.94 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  31.55 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  32.48 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  29.6 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  27.88 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  28.04 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  31.23 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  30.13 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  27.13 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  27.67 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  27.48 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  28.03 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  28.89 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  28.43 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  28.39 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  28.17 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  27.16 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  28.39 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  27.07 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  27.48 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  27.07 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  27.07 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  30.13 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  30.13 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  26.75 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  26.52 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  27.48 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  26.52 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  27.07 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  27.16 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  27.16 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  27.8 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  27.57 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  27.48 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  28.43 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  27.16 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  29.21 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  29.21 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  27.16 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  27.16 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  27.16 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  25.88 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  27.21 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  27.71 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  25.88 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  25.88 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  25.88 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  25.88 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  25.88 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  25.88 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  27.42 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  27.24 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  26.75 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  26.11 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  26.25 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  27.16 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  28.89 
 
 		 334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  28.34 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  26.58 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  27.44 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  27.76 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  27.76 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  27.76 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  29.52 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  27.76 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  27.76 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  27.76 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  26.51 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2399  flagellar motor switch protein FliM  29.52 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2536  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  26.5 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  28.25 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  27.24 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  28.25 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  28.25 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  27.65 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>