More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0200 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  82.37 
 
 		 442 aa  733    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  87.5 
 
 		 448 aa  776    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 448 aa  889    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  75.4 
 
 		 447 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  70.31 
 
 		 442 aa  620  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  69.61 
 
 		 442 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  68.62 
 
 		 447 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  59.45 
 
 		 441 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  57.6 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  57.6 
 
 		 441 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  58.6 
 
 		 447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  58.53 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  59.45 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  54.5 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  56.12 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  56.22 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  52.09 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  51.62 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  51.39 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  53.4 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  51.4 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  50 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  49.65 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  48.51 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  48.39 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  52.8 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  48.16 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  50.81 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  53.95 
 
 		 422 aa  362  9e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  51.88 
 
 		 412 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  53.05 
 
 		 424 aa  359  7e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  48.64 
 
 		 432 aa  348  8e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  52.35 
 
 		 424 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  50.35 
 
 		 437 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  46.87 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  44.63 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  47.95 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  45.29 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  48.84 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  45.91 
 
 		 397 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  38.83 
 
 		 429 aa  305  9.000000000000001e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  45.66 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  38.16 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  39.26 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  41.72 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  38.61 
 
 		 442 aa  256  4e-67  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  39.44 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  37.88 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  33.64 
 
 		 457 aa  206  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.73 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  37.95 
 
 		 437 aa  204  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  32.55 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  32.48 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 		 432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  36.55 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.32 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  36.7 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  32.78 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  33.88 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.43 
 
 		 427 aa  190  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.71 
 
 		 466 aa  190  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.21 
 
 		 438 aa  189  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  35.58 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  36.41 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.71 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.89 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  34.58 
 
 		 422 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  35.8 
 
 		 440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.16 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  38.51 
 
 		 431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  32.19 
 
 		 459 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.96 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  36.84 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.78 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  34.2 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  36.58 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  38.66 
 
 		 442 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  39.51 
 
 		 431 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  42.45 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.52 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  35.88 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.86 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.07 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.51 
 
 		 422 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.51 
 
 		 422 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  30.09 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  34.1 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.28 
 
 		 422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  29.95 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.28 
 
 		 422 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  34.22 
 
 		 411 aa  172  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  34.02 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  36.67 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  35.19 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>