119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4037 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4037  NnrS  100 
 
 		 408 aa  796    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  91.2 
 
 		 409 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  79.17 
 
 		 408 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  64.99 
 
 		 403 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  70.51 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  60.5 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  58.76 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  56.35 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  58.27 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  57.89 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  42.96 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  42.46 
 
 		 413 aa  295  9e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  41.81 
 
 		 414 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  52.44 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  44.1 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  43.11 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  45.93 
 
 		 391 aa  265  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  47.42 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  47 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  40.69 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  48.02 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  42.06 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  47.49 
 
 		 397 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  43.42 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  45.67 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  34.97 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  33.95 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  35.23 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  34.3 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  35.91 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  33.68 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  33.68 
 
 		 390 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  33.42 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  31.97 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  33.77 
 
 		 390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  38.01 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  36.48 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  35.13 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  33.25 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  33.25 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  34.11 
 
 		 401 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  31.11 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  36.06 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  31.76 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  34.34 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  34.34 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  34.34 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  34.34 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  32.01 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  34.27 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  36.32 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  36.79 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  36.52 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  35.37 
 
 		 407 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  28.61 
 
 		 393 aa  146  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  30.36 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  34.34 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  34.82 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  34.82 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  34.82 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  34.82 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  34.82 
 
 		 407 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  30.2 
 
 		 422 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  37.28 
 
 		 393 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  32.98 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  32.98 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  34.09 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  34.82 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  34.09 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  35.71 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  34.1 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  33.93 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  31.07 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  32 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  31.46 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  32.29 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  28.34 
 
 		 394 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  34.99 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  36.18 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  29.69 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  35.04 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  35.73 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  30.43 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  31.76 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  29.47 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  33.67 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  33.93 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  36.09 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  27.68 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  29.97 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  30.73 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  26.53 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  33.91 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  31.49 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  35.51 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  28.54 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  32.2 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  31.95 
 
 		 404 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  28.02 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  35.17 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>