More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1435 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0995  alanine dehydrogenase/PNT  87.7 
 
 
376 aa  673    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1435  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  100 
 
 
374 aa  743    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3968  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  87.97 
 
 
375 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52416  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1415  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  95.99 
 
 
374 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284122  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1227  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  87.97 
 
 
376 aa  679    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4662  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  90.37 
 
 
375 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.320947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6858  nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit alpha1  86.63 
 
 
375 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1948  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.8 
 
 
387 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2882  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.28 
 
 
379 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2759  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.54 
 
 
379 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0209  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  74.34 
 
 
379 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2986  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.81 
 
 
379 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.758853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3144  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.54 
 
 
379 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2800  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.87 
 
 
409 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2759  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  72.16 
 
 
382 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3538  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.62 
 
 
380 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0973  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  70.92 
 
 
429 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0913  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  70.92 
 
 
476 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1384  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.31 
 
 
440 aa  519  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3368  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  70.46 
 
 
382 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3670  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  69.27 
 
 
382 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.341864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0891  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  67.83 
 
 
378 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861705  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2806  alanine dehydrogenase/PNT-like  67.39 
 
 
438 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2547  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.77 
 
 
376 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2058  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.73 
 
 
377 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000804749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3255  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  67.55 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0956  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  58.38 
 
 
391 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00245688  hitchhiker  0.000000175975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2183  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.03 
 
 
384 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219825  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2157  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.94 
 
 
380 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1183  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.95 
 
 
377 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281114  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1843  alanine dehydrogenase/PNT-like  57.07 
 
 
375 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3786  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  55.82 
 
 
385 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1514  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  54.09 
 
 
376 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.466111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1797  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.77 
 
 
376 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.379193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2684  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.23 
 
 
379 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  54.35 
 
 
372 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0114  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.94 
 
 
373 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4546  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  54.32 
 
 
371 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4008  putative NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  54.23 
 
 
380 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2963  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  53.74 
 
 
401 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2823  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  54.69 
 
 
373 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1151  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.21 
 
 
375 aa  365  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0971  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  55.95 
 
 
373 aa  364  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.594056  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0691  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  54.23 
 
 
380 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144768  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6407  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  54.2 
 
 
372 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.443533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2559  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.89 
 
 
379 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5070  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.8 
 
 
373 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0853824  hitchhiker  0.00742692 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2969  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.89 
 
 
379 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0216  alanine dehydrogenase/PNT-like  52.89 
 
 
379 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0700  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.89 
 
 
379 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.27 
 
 
373 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0667  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.46 
 
 
379 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5016  alanine dehydrogenase/PNT  52.67 
 
 
373 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02450  putative NAD(P) transhydrogenase, subunit alpha part 1  51.87 
 
 
372 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0175  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.73 
 
 
373 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4431  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.14 
 
 
373 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.447977 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6085  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.13 
 
 
372 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0275  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.34 
 
 
372 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01860  NAD(P) transhydrogenase, subunit alpha part 1  52.14 
 
 
390 aa  354  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0301243  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5720  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.68 
 
 
372 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.867583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.11 
 
 
380 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3568  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.08 
 
 
372 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5292  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.86 
 
 
372 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0721444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3954  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.7 
 
 
371 aa  349  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0427  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.66 
 
 
380 aa  348  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3430  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  51.07 
 
 
385 aa  348  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0682  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.35 
 
 
384 aa  348  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6362  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.59 
 
 
372 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3303  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.97 
 
 
371 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1259  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  53.3 
 
 
379 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408266  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2730  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit  52.72 
 
 
379 aa  345  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2366  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  53.03 
 
 
379 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1142  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  53.03 
 
 
379 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3394  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.03 
 
 
379 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3387  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  53.03 
 
 
379 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3352  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  53.03 
 
 
379 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2546  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  53.03 
 
 
379 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0280  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  52.89 
 
 
454 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4259  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.88 
 
 
372 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0636  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.34 
 
 
377 aa  344  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00479948  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0336  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  55.28 
 
 
371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0391  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.06 
 
 
376 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3800  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.16 
 
 
371 aa  342  9e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6044  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.47 
 
 
376 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0543  alanine dehydrogenase/PNT-like  50.39 
 
 
385 aa  331  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0949  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit P  50 
 
 
376 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1274  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  45.84 
 
 
378 aa  329  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000453292  normal  0.267314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4748  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.87 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2277  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.05 
 
 
524 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.317985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1883  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  48.41 
 
 
523 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0240  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  48.15 
 
 
523 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.986239  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0555  putative pyridine nucleotide transhydrogenase  50.13 
 
 
385 aa  324  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.410475  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3200  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.71 
 
 
385 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0144615  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2768  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.15 
 
 
512 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2896  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.44 
 
 
385 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0854  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.68 
 
 
508 aa  322  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00327911  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0891  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.68 
 
 
508 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.210446  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4705  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.88 
 
 
380 aa  322  8e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3081  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.68 
 
 
508 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12211  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit alpha 1 (A1)  44.5 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236415  normal  0.205438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>