More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1948 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1948  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  100 
 
 
387 aa  768    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3968  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.27 
 
 
375 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52416  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1415  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.6 
 
 
374 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284122  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1435  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.8 
 
 
374 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4662  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.93 
 
 
375 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.320947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0995  alanine dehydrogenase/PNT  72.75 
 
 
376 aa  555  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1227  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  72.75 
 
 
376 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2882  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  71.43 
 
 
379 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2986  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  70.63 
 
 
379 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.758853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6858  nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit alpha1  71.35 
 
 
375 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2759  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  70.63 
 
 
379 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2800  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  71.28 
 
 
409 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0209  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  72.94 
 
 
379 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3144  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  72.22 
 
 
379 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0973  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  72.24 
 
 
429 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0913  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  72.24 
 
 
476 aa  522  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1384  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  72.48 
 
 
440 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2759  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.08 
 
 
382 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3538  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.7 
 
 
380 aa  507  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3670  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  71.35 
 
 
382 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.341864 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2806  alanine dehydrogenase/PNT-like  70.59 
 
 
438 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3368  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  70.72 
 
 
382 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0891  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.54 
 
 
378 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861705  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3255  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  71.47 
 
 
448 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2058  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  61.76 
 
 
377 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000804749 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2547  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  61.64 
 
 
376 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0956  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  60.47 
 
 
391 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00245688  hitchhiker  0.000000175975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2183  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.68 
 
 
384 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219825  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2157  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.47 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1514  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  53.68 
 
 
376 aa  371  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.466111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1183  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.15 
 
 
377 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281114  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1797  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.89 
 
 
376 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.379193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0114  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.86 
 
 
373 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1151  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.74 
 
 
375 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5070  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.6 
 
 
373 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0853824  hitchhiker  0.00742692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.33 
 
 
373 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0175  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.33 
 
 
373 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01860  NAD(P) transhydrogenase, subunit alpha part 1  52.07 
 
 
390 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0301243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1843  alanine dehydrogenase/PNT-like  54.99 
 
 
375 aa  363  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2963  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  52.28 
 
 
401 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5016  alanine dehydrogenase/PNT  50.53 
 
 
373 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.26 
 
 
372 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0971  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  54.99 
 
 
373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.594056  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6085  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.36 
 
 
372 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02450  putative NAD(P) transhydrogenase, subunit alpha part 1  50.53 
 
 
372 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4431  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.4 
 
 
373 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.447977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2684  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.89 
 
 
379 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2823  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.07 
 
 
373 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0275  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.27 
 
 
372 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2559  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.6 
 
 
379 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2969  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.6 
 
 
379 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3786  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.84 
 
 
385 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4259  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.59 
 
 
372 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4546  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.73 
 
 
371 aa  339  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6407  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.54 
 
 
372 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.443533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4008  putative NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  50.53 
 
 
380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0691  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.26 
 
 
380 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144768  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3954  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.08 
 
 
371 aa  335  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.48 
 
 
380 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0216  alanine dehydrogenase/PNT-like  50.52 
 
 
379 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0700  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.52 
 
 
379 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0667  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.79 
 
 
379 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3303  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.81 
 
 
371 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2730  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit  50.27 
 
 
379 aa  332  6e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6044  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.6 
 
 
376 aa  332  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0391  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.95 
 
 
376 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5292  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.54 
 
 
372 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0721444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2768  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.21 
 
 
512 aa  329  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5720  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.17 
 
 
372 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.867583  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6362  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.36 
 
 
372 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0427  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.28 
 
 
380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3568  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.2 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3194  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.72 
 
 
509 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0682  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.71 
 
 
384 aa  326  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3430  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  49.07 
 
 
385 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3200  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.18 
 
 
385 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0144615  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2896  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.18 
 
 
385 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2971  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.14 
 
 
365 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3740  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.92 
 
 
508 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0949  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit P  48.28 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4580  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  49.47 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.620046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2840  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.11 
 
 
508 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2366  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  51.83 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3394  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.83 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1259  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  51.83 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3387  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  51.83 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1142  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  51.83 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2546  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  51.83 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3352  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  51.83 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2174  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  49.2 
 
 
513 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0277505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0280  NAD(P) transhydrogenase, alpha-1 subunit  51.83 
 
 
454 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0891  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.92 
 
 
508 aa  318  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.210446  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0854  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.92 
 
 
508 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00327911  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3081  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.92 
 
 
508 aa  318  9e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2313  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.58 
 
 
528 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.530452  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1976  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.8 
 
 
382 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.286018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3800  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.51 
 
 
371 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.900999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01572  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.58 
 
 
510 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2040  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  45.58 
 
 
510 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0791488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01562  hypothetical protein  45.58 
 
 
510 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>