30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0012 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0012  FixH  100 
 
 
166 aa  333  6e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  78.31 
 
 
166 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  77.11 
 
 
166 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  69.28 
 
 
166 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  61.9 
 
 
148 aa  188  3e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  40.24 
 
 
166 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  40 
 
 
169 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  41.25 
 
 
172 aa  112  2e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  40.51 
 
 
166 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  35.22 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  34.15 
 
 
160 aa  72.4  3e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  32.59 
 
 
156 aa  66.2  2e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  33.55 
 
 
156 aa  65.9  3e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  32.1 
 
 
267 aa  63.5  1e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  30.41 
 
 
158 aa  60.1  1e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  34.48 
 
 
157 aa  59.3  2e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  30.56 
 
 
273 aa  58.2  5e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  27.91 
 
 
169 aa  56.2  2e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  30.19 
 
 
152 aa  55.5  3e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  31.21 
 
 
154 aa  53.1  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  24.83 
 
 
168 aa  51.2  6e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  32.63 
 
 
155 aa  51.2  6e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  37.5 
 
 
156 aa  51.2  7e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  41.54 
 
 
152 aa  50.1  2e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  41.79 
 
 
152 aa  49.7  2e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  29.13 
 
 
186 aa  48.9  3e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0163  FixH family protein  30 
 
 
275 aa  48.5  4e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  26.72 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  24.43 
 
 
165 aa  42  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  24.43 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>